如何下載整個CRAN存儲庫？

對於沒有Internet的離線linux機器，安裝具有大量依賴的R包是一場噩夢。我在SE上發現了幾篇文章，討論如何創建本地文件夾，複製所需的軟件包zip文件並使用'install.packages'進行安裝。如何下載整個CRAN存儲庫？

但是，查找，下載和上傳大量軟件包到脫機服務器是一項非常耗時的工作。所以，我想知道如何下載所有CRAN軟件包的整個zip文件，以便我可以將它們放在本地離線機器的http web服務器目錄中，並且像真正的存儲庫一樣。規模可能會在200 GB左右非常大，但對於企業環境，我認爲這應該是有道理的。

我找到了一個指導here討論如何成爲官方CRAN鏡像，但我不打算成爲官方的公共鏡像。

請指教。在此先感謝

來源

2016-08-20 Espanta

您仍然可以遵循CRAN鏡像howto的建議，而不是使鏡像正式運行，但只需在內部機器上運行即可。 –

訪問此鏈接，查看問題是否已解決。 http://stackoverflow.com/questions/10807804/offline-install-of-r-package-and-dependencies –

做@AchimZeileis建議和鏡像CRAN。它最終減輕了服務器的負擔，並且可以在目錄結構中探索和發現一些隱藏的寶石（例如具有優秀元數據的rds文件）。我今年早些時候設置了一個本地/家庭的CRAN鏡像，並且它的安裝過程非常棒，只需幾毫秒。您還可以有選擇地對其進行鏡像（即，如果您沒有這些系統，可以排除Windows或MacOS目錄結構）。 – hrbrmstr

您可以使用函數available.packages來查找可用包。

pkgnames <- available.packages()[,1]

如果你喜歡網頁抓取，你可以練習如下。

library(rvest) 
pkgs <- read_html("https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html") 
tab <- html_nodes(pkgs, "table") %>% html_table(fill = TRUE) 

pkgnames <- tab[[1]][1]$X1 
pkgnames <- pkgnames[nchar(pkgnames)>0]

不要運行這些，除非你想安裝（或下載）包了很多！

#sapply(pkgnames, install.packages) 
#sapply(pkgnames, install.packages)

您可以運行此行來顯示它的工作原理。

sapply(pkgnames[1:2], install.packages)

您可以用destdir參數將其保存到您的企業目錄一起更換install.packages與download.packages。

來源

2016-08-20 07:31:52 shayaa

只需使用'available.packages（）'就可以獲得有關CRAN上所有可用軟件包的信息。你不需要爲此解析HTML頁面。 –

我喜歡網絡報廢Shayaa ..謝謝 – Espanta

您的解決方案不會下載包，而是安裝它們。我沒有在服務器上訪問互聯網。如果您將install.packages更改爲download.packages（） – Espanta

如何下載整個CRAN存儲庫？

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