2012-01-23 276 views
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我一直在試圖在Mac上的R中安裝一些bioconductor軟件包。但是,使用軟件包安裝程序時,應用程序會凍結並且無法響應。當我在R中使用命令行安裝程序時,不會發生同樣的事情 - 安裝程序會立即下載並運行程序包。從Macbook上的軟件包安裝程序安裝軟件包時R凍結

任何想法發生了什麼?

謝謝, 大衛

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這是沒有足夠的信息提供有意義的建議。請閱讀R-help發佈指南:http://www.r-project.org/posting-guide.html或關於如何提出「良好問題」的其他材料。 –

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通常「凍結」僅僅意味着它只是簡單地下載+安裝軟件包,但只有在完成後才能得到反饋 - 沒有進度更新。 –

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在Simon的R.app GUI中使用包安裝程序時,我看到了同樣的情況,並得出了與Simon建議的相同結論。無論出於何種原因,從cran.r-project.org(或mirror)站點下載zip文件通常要快得多,並且告訴軟件包安裝程序從本地源包安裝。 –

回答

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Mac的圖形用戶界面不提供任何反饋,直到所有的軟件包已成功安裝。因此,它實際上只是在等待軟件包的安裝過程(下載+安裝)完成時看起來「凍結」。

請注意,BioC的下載速度通常非常慢(包裝可能很大),所以這是人們傾向於僅通過BioC報告此情況的主要原因之一。

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我想那一定是那麼。這是唯一合乎邏輯的解釋。謝謝! – user1165927

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從終端運行R二進制文件時,我在OS X上也遇到同樣的問題。可能是一個單獨的問題,但可能不是。還沒有弄清楚根本原因。 –