我一直在Ubuntu中使用R來使用system()來進行系統調用，例如啓動Amazon EC2實例，管理S3上的文件等。如果我從命令行啓動R，那麼一切正常。但是，如果我使用Rscript或ESS從腳本啓動R，則在設置環境變量時遇到問題。在R中爲system（）設置環境變量？
我認爲這是一個問題，我沒有正確地grokking在Ubuntu設置環境變量。我認爲「正確的地方」（對於「右」的一些定義）是在〜/ .bashrc中設置用戶環境變量。這是我設置的東西，如export EC2_HOME=/home/jd/ec2，但是當我從ESS執行R並進行系統調用時，不會運行.bashrc腳本。我嘗試過使用Googing，並且在Ubuntu中看到許多對環境變量的解釋，例如this one。我的膝蓋混亂反應是嘗試上述線程中的每個建議，並在其中一個選項有效時立即停止提供一個垃圾。但後來我終於遇到了一些非標準的設置，這些設置後來讓我陷入了屁股。
那麼我應該如何設置環境變量，以便在R中運行system()調用時正確設置？
我認爲你是混亂的問題看你的.bashrc文件。我擔心這可能是關於登錄shell與非登錄shell的關係。細節請參閱bash手冊頁......這在過去使我瘋狂。
也就是說，如果你可以設置環境變量系統範圍內，你有幾種選擇：
/etc/environment是一個非常好的地方，因爲它是殼無關，你應該永遠使用不同的外殼~/.local_bashrc從添加. ~/.local_bashrc和所有的
~./bashrc~/.bash_profile等頁。
你可以先用echo Hello from FILE採購，你的名稱替換文件的文件。這顯示了從登錄開始（例如通過gdm等），通過ssh連接，通過新的xterm等終端等的shell之間的區別。
該死的好技巧，一如既往的德克。我很想開始編輯'/ etc/environment'，但是每當我開始在'/ etc /'中搞一些東西時，我聽到一個德語重音的聲音很溫和地說'學得不快，是嗎？'而且我有點cree然心動，重新考慮離開家庭農場並在大城市追求生活的決定。 – 2010-10-08 17:17:13
您可以嘗試使用Sys.setenv將它們設置在R本身中。
好吧。我試圖通過Ubuntu的方法來做到這一點，並沒有意識到有一種R方法。謝謝！ – 2010-10-08 16:53:16
和'Renviron'。 'Renviron.site'和'〜/ .Renviron'。 – 2015-11-24 18:16:21
您可以強制系統使用source命令
source ~/.bashrc
大量的不雅和醜陋的方式來應用此
炒鍋，感謝您對標籤的幫助！ – 2010-10-08 16:47:17