2011-07-27 239 views
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自從昨天以來,我陷入了一個小而棘手的問題。Python - 迭代嵌套列表

我所擁有的是一個(可能無限)嵌套表是這樣的:

[1,[2,[3,4]]] 
or [[1,2],[3,4]] and so on. 

每個級別上的列表包括兩個子表,(我沒有使用元組,因爲該名單可能會得到任意長度在下一步中) 現在我想在此列表中的每個可能位置插入一個元素,並返回所有可能插入位置列表的列表。 所以,如果我插入5,我的輸出應該是這樣的:

[ [5,[1,[2,[3,4]]]], 
[1,[5,[2,[3,4]]]], 
[1,[2,[5,[3,4]]]], 
[1,[2,[[3,5],4]]], 
[1,[2,[3,[4,5]]]] ] 

背景:我試圖通過在每次添加一個類羣來構建系統發育樹。每個分類單位必須插入最合適的位置。

我現在得到的是:

def get_trees(nwklist,newid): 
    if not isinstance(nwklist,list): 
     return [newid,nwklist] 
    else: 
     return [newid,nwklist],[get_trees(nwklist[0],newid),nwklist[1]],[nwklist[0],get_trees(nwklist[1],newid)] 

不產生我想要的輸出,但說到有點接近。

([5, [1, [2, [3, 4]]]], 
[[5, 1], [2, [3, 4]]], 
[1, ([5, [2, [3, 4]]], [[5, 2], [3, 4]], [2, ([5, [3, 4]], [[5, 3], 4], [3, [5, 4]])])]) 

應該有一個簡單的解決方案,可能涉及lambda函數,但我只是沒有看到它。

克里斯托夫

+6

你幾乎肯定會重新發明輪子。 Python中有處理進化樹的軟件包,比如Biopython的Phylo(http://www.biopython.org/wiki/Phylo)或dendropy(http://pypi.python.org/pypi/DendroPy) –

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只是挑剔的:你的列表可能具有*任意*深度,但不具有*無限*深度。至少,我不知道如何。 –

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「每個分類單位必須插入最合適的位置。」這聽起來像試圖構建一個鄰居加入樹,這是一個不好的計劃。查找更多關於如何最好地構建系統發育樹的文獻,以及爲什麼最簡單的方法也是最差的。 – pyvi

回答

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我會使用一個發電機:

def gen_trees(nwklist, newid): 
    yield [newid] + [nwklist] 
    if isinstance(nwklist, list): 
    for i in xrange(len(nwklist)): 
     for l in gen_trees(nwklist[i], newid): 
     yield nwklist[:i] + [l] + nwklist[i+1:] 
    yield [nwklist] + [newid] 

for l in gen_trees([1,[2,[3,4]]] , 5): 
    print l 

請注意,這個返回的樹木超過在您的示例所示:

[5, [1, [2, [3, 4]]]] 
[[5, 1], [2, [3, 4]]] 
[[1, 5], [2, [3, 4]]] 
[1, [5, [2, [3, 4]]]] 
[1, [[5, 2], [3, 4]]] 
[1, [[2, 5], [3, 4]]] 
[1, [2, [5, [3, 4]]]] 
[1, [2, [[5, 3], 4]]] 
[1, [2, [[3, 5], 4]]] 
[1, [2, [3, [5, 4]]]] 
[1, [2, [3, [4, 5]]]] 
[1, [2, [[3, 4], 5]]] 
[1, [[2, [3, 4]], 5]] 
[[1, [2, [3, 4]]], 5] 

據我所看到的,這符合規定的要求。如果有一些未明確提出的要求我沒有得到(例如,如果每個子列表的第一個元素必須是標量),請澄清,我將更新解決方案。

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謝謝!這看起來非常好。 它不止是我列出的,我忘記提到訂單是不重要的,所以 [1,[[5,2],[3,4]]] [1,[[2,5],[3 ,4]]] 基本上是一樣的樹。 – Christoph

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如果我刪除第二個yield [nwklist] + [newid]行,我就得到了我想要的。 非常感謝! – Christoph