通過f2py Fortran擴展到Python：如何配置文件？

我在使用f2py（Ver.2）編譯的Fortran（gfortran 4.4.7）中編寫的擴展名爲Python（2.7.2）。通過f2py Fortran擴展到Python：如何配置文件？

我可以使用cProfile來剖析Python部分，但結果並不提供有關Fortran函數的任何信息。相反，時間歸因於調用Fortran函數的Python函數。

我已經啓用了「-pg O」標誌爲我打造，以及在f2py呼叫通過創建共享對象的所有的Fortran對象：f2py --opt="-pg -O" ...

如何得到任何提示Fortran信息也非常感謝。

如果有人使用類似的設置，使用不同的分析器，我也會感興趣。

2013-05-14 NichtJens

FWIW，因爲這個原因，我停止使用f2py ......很難進入Fortran代碼，看看發生了什麼。問題在於Fortran代碼被C代碼包裝，進一步混淆了這種情況。 – SethMMorton 2013-05-14 18:23:59

也許你應該試試pythonic方法：將測試例程放在Python模塊的'if __name __ =='__ main __「：'部分是一個好習慣。所以我建議編寫一個單獨的Fortran程序來分別描述這個部分。 – Stefan 2013-05-15 06:39:10

Fortran函數調用顯示爲'：84（）'。確實，你無法確定哪個模塊被調用，但它給了你一個想法。另一種方法是將其封裝到Python函數中，然後查看Python函數的時間。 – ilciavo 2015-06-23 16:42:50

的Fortran函數調用顯示爲：

<ipython-input-51-f4bf36c6a947>:84(<module>).

我知道，你不能確定被稱爲該模塊，但至少這給你的想法。

另一種方式是將其封裝到Python函數中，然後查看Python函數的計時。

來源

2016-06-26 06:42:40 ilciavo

看看python擴展profiler yep。

來源

2014-08-07 20:02:22

該手冊說使用'ppref'來讀取'file.prof'。你能簡單解釋一下怎麼做嗎？ – ilciavo 2015-06-23 16:46:14

我懷疑'pperf'這個名字是一個錯字。它可能會說'pprof'（來自Google的[perftools]（http://google-perftools.googlecode.com/svn/trunk/doc/cpuprofile.html）） – 2015-06-24 18:47:45

yep依賴於google-perftools，它有64位的問題系統。從它的文檔：「在64位系統上的glibc內置堆棧解卷器在perftools庫中存在一些問題」。出於這個原因，我無法使用它。 – Florian 2017-07-10 09:10:25

這個工作流程似乎工作得很好：

1. 使用callgrind分析代碼（這會產生像callgrind.out.27237文件）：

valgrind --tool = callgrind python my_python_script_calling_f2py_functions.py arg1 arg2

轉換爲.DOT文件（如果需要，可以安裝與gprof2dot：「PIP安裝的git + https://github.com/jrfonseca/gprof2dot」）

gprof2dot -f callgrind callgrind.out.27237> callgrind.dot

創建graphviz的的曲線圖（見本計算器問題Interpreting callgrind data）：

點-Tjpg callgrind.dot -o callgrind。jpg

來源

2017-07-10 09:08:59 Florian

通過f2py Fortran擴展到Python：如何配置文件？

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