Networkx圖形邊緣繪製錯誤

我有以下代碼可用於隨機圖表可以顯示。但是，當我嘗試使用其他圖形類型時，在邊緣繪製函數中出現錯誤。特別是邊緣位置。Networkx圖形邊緣繪製錯誤

如果你對此有何評論

G = nw.random_geometric_graph(200, 0.125)

，並取消註釋出現

G = nw.barabasi_albert_graph(200, 2)

錯誤消息。我是新來的python和NetworkX特別是任何幫助表示讚賞！

import matplotlib.pyplot as plt 
import networkx as nw 

G = nw.random_geometric_graph(200, 0.125) 

#G = nw.watts_strogatz_graph(200, 3, 0.125, seed=None) 
#G = nw.barabasi_albert_graph(200, 2) 

# position is stored as node attribute data for random_geometric_graph 
pos = nw.get_node_attributes(G, 'pos') 

# find node near center (0.5, 0.5) 
dmin = 1 
ncenter = 0 
for n in pos: 
    x, y = pos[n] 
    d = (x - 0.5) ** 2 + (y - 0.5) ** 2 
    if d < dmin: 
     ncenter = n 
     dmin = d 

# color by path length from node near center 
p = nw.single_source_shortest_path_length(G, ncenter) 

plt.figure(figsize=(8, 8)) 

nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4) 
nw.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=list(p.keys()), node_size=80, node_color=list(p.values()), cmap=plt.cm.Reds_r) 

plt.xlim(-0.05, 1.05) 
plt.ylim(-0.05, 1.05) 
plt.axis('off') 
plt.savefig('random_geometric_graph.png') 
plt.show()

給出的錯誤信息是;

--------------------------------------------------------------------------- 
KeyError         Traceback (most recent call last) 
<ipython-input-11-> in <module>() 
    22 plt.figure(figsize=(8,8)) 
    23 
---> 24 nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4) 
    25 nw.draw_networkx_nodes(G, pos, nodelist=list(p.keys()), node_size=80, node_color=list(p.values()), cmap=plt.cm.Reds_r) 
    26 

/Users//anaconda/lib/python3.6/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py in draw_networkx_edges(G, pos, edgelist, width, edge_color, style, alpha, edge_cmap, edge_vmin, edge_vmax, ax, arrows, label, **kwds) 
    513 
    514  # set edge positions 
--> 515  edge_pos = numpy.asarray([(pos[e[0]], pos[e[1]]) for e in edgelist]) 
    516 
    517  if not cb.iterable(width): 

/Users//anaconda/lib/python3.6/site-packages/networkx/drawing/nx_pylab.py in <listcomp>(.0) 
    513 
    514  # set edge positions 
--> 515  edge_pos = numpy.asarray([(pos[e[0]], pos[e[1]]) for e in edgelist]) 
    516 
    517  if not cb.iterable(width): 

KeyError: 0

來源

2017-04-20 AngusTheMan

如果您有錯誤，請將它們包含在帖子中並突出顯示哪條特定行會導致錯誤 – EdChum

'pos = nw.get_node_attributes（G，'pos'）'適用於隨機幾何圖形。對於其他人，它只是將'pos'設置爲'{}'（空字典）。 – Joel

我不認爲任何其他圖形初始化方法除了random_geometric_graph設置節點位置自動（如本圖中的連通性依賴於節點位置，是有意義的設置一個默認情況下）。如果你用watts_strogatz_graph檢查你的例子，返回的字典實際上是空的（儘管它可能會拋出KeyError）。

您需要明確確定佈局，例如，使用

pos = nw.spring_layout(G)

或任何其他佈局算法。

來源

2017-04-20 13:28:36 Paul

你可以看到這個問題（從堆棧跟蹤）是在這一行：

nw.draw_networkx_edges(G, pos, nodelist=[ncenter], alpha=0.4)

和錯誤是KeyError，這樣的東西不能被發現。可能你需要在這裏畫edges，但你確實提供了nodelist。根據official docs，繪製edges的方法應該接受edgelist，而不是nodelist。

所以，你需要這樣做：

nw.draw_networkx_edges(G, pos, edgelist=[SOME_EDGES_HERE], alpha=0.4)

請注意，這應該是邊緣，而不是節點，所以你需要從中心節點找到他們。

來源

2017-04-20 19:42:36 VMAtm

Networkx圖形邊緣繪製錯誤

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