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有沒有辦法使用sed在單個fasta文件中更改多個(最多十個)模式? 比如我想改變用於Y的X:sed編輯多個模式
sed "s/X/Y/g" <file1.fasta> output.fasta
如何sed "s/\s/_/g"
和8個命令添加到同一個班輪?
有沒有辦法使用sed在單個fasta文件中更改多個(最多十個)模式? 比如我想改變用於Y的X:sed編輯多個模式
sed "s/X/Y/g" <file1.fasta> output.fasta
如何sed "s/\s/_/g"
和8個命令添加到同一個班輪?
您可以用分號
sed 's/a/b/;s/c/d/'
分隔命令(你也可以使用換行符,而不是分號)
,或者您可以使用多個-e
S:
sed -e 's/a/b/' -e 's/c/d/'
看到這個例子:(用gnu sed測試):
kent$ echo 'abcd'|sed 's/a/1/;s/b/2/;s/c/3/;s/d/4/'
1234
kent$ echo 'abcd'|sed 'y/abcd/1234/'
1234
不禁用換行線,所以這將是不正確的;你期望bash,awk和python標籤在這裏實現什麼? –
你是否每次都更換所有單個字符? – anubhava
我通常會將.fasta擴展名更改爲.txt,然後使用bash操作它 – Bio21