Unix Bash腳本運行但沒有輸出

我想創建一個bash腳本，它將根據文件類型循環一組文件，然後用文件名創建一個目錄，然後通過javascript運行該文件，將它輸出到創建的目錄中。Unix Bash腳本運行但沒有輸出

#!/bin/bash 

FILES=/home/ndevon/BRAD/Original_Files/*60_R1.fastq.gz 
for f in $FILES 
do 
    echo mkdir $f 
    echo nohup /home/pszoevenyi/executables/FastQC/./fastqc [-t 2] [-o $f] [- 
f fastq] $f & 
done

但是，當我運行這一切似乎工作正常，但沒有輸出。我使用ps x檢查了活動作業，它告訴我隊列中有一個-bash命令類型，但它有一個Ss狀態。我對unix和bash非常陌生，實際上我今天就開始了，但我無法弄清楚爲什麼這樣做不起作用。

謝謝

來源

2017-06-02 bohawk

無論如何，至少應該看到'mkdir/home/ndevon/BRAD/Original_Files/* 60_R1.fastq.gz'，你應該得到一些輸出......請用你看到的更新你的問題，以及你如何運行它。我可以看到一些問題：你正在嘗試對文件名進行mkdir等。如果你的文件名包含空格，這也會有問題，但我會假設你沒有。 – blackghost

是的，你應該看到輸出。但是我看到另一個問題：您將嘗試創建一個與現有文件名稱相同的目錄 - 這是行不通的。 – linuxfan

你說過活躍的工作嗎？你的意思是背景工作，在工作或cron工作？ – alvits

你不需要「回聲」你運行的每個命令。通過簡單地運行它而不用回顯，你應該看到輸出。

你試過嗎？

來源

2017-06-02 17:58:03

對不起，這個答案應該是一個評論，而不是。而且，OP可能使用回聲來測試循環。我建議你刪除你的答案。 – linuxfan

如果系統允許我添加評論，我會很高興。但是，看起來新人不能做什麼，除了看。 –

我明白你的問題，但1）有耐心，你可以發表評論; 2）我再說一遍，這不是一個足夠的答案 - 它大多是錯誤的。 – linuxfan

如果您沒有看到任何輸出，那意味着您的循環根本沒有執行。也許沒有/home/ndevon/BRAD/Original_Files/*60_R1.fastq.gz文件，所以循環可以簡單地跳過，沒有任何回聲或錯誤消息。

來源

2017-06-02 19:54:14 phd

錯了。如果沒有文件，那麼'FILES'和'f'都將具有一個文字值'/ home/ndevon/BRAD/Original_Files/* 60_R1.fastq.gz'。循環只會執行一次。 – alvits

Unix Bash腳本運行但沒有輸出

回答

相關問題