一臺機器上在OS X上使用的mpirun

我在單機模式下使用mpirun在OS X上使用mpirun -np 5 my_program運行我的程序麻煩，我得到了下面的錯誤輸出：一臺機器上在OS X上使用的mpirun

[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/pls/base/pls_base_orted_cmds.c at line 275 
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/pls/rsh/pls_rsh_module.c at line 1158 
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/errmgr/hnp/errmgr_hnp.c at line 90 
mpirun noticed that job rank 1 with PID 85940 on node ...-MacBook-Pro.local exited on signal 6 (Abort trap). 
2 additional processes aborted (not shown)

顯然，在默認情況下mpirun使用rsh連接到機器。我試着用ssh代替，但它並沒有幫助：

mpirun --mca pls_rsh_agent ssh -np 5 my_program

然後，我嘗試使用共享內存（sm）BTL，這並沒有幫助：

mpirun --mca btl self,sm -np 5 my_program

最後，我試圖用一臺機器文件來指定，我只希望使用localhost，這並沒有幫助：

mpirun -np 5 -machinefile machinefile.local my_program

這裏，machinefile.local只包含（單）第一行上的。

在上述所有情況下，我都會收到上面的超時錯誤。

另外，我驗證了我的Mac OS X防火牆沒有運行，並且我可以SSH入我的機器。

來源

2011-03-02 Philipp Haller

所以它看起來像你使用fink的OpenMPI版本，是嗎？/usr/bin和/ usr/lib中是否還有原始的1.2.x MPI？尋找奇怪的啓動問題的第一個地方是MPI庫的衝突版本。

首先嚐試一些簡單的東西，如/usr/bin/mpirun -np 5 hostname，然後無論你的fink mpirun是否做同樣的事情：/path/to/fink/mpirun -np 5 hostname，只是爲了確保兩個MPI啓動器在非MPI程序上工作。然後在my_program上執行ldd;它鏈接到哪些庫？對這些庫使用適當的mpirun，並查看是否有效。

來源

2011-03-03 13:53:40

檢查您的防火牆，並確保它允許mpirun建立入站和出站連接。

來源

2011-03-04 15:31:27 powerrox

一臺機器上在OS X上使用的mpirun

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