恢復不完整的PDF文件

Question

考慮下面的代碼，這是一個集羣上運行時walltime（#BSUB -W 10:00）：競爭for循環之前

pdf("myPlots.pdf") 
for(i in 1:300){ 
# a lot of data processing, unfortunately no data is being saved... 
# ... 

# then plot output 
plot(1) 
} 
dev.off() 

上面代碼中退出，（因爲walltime）和PDF是不完整。 然後，我用this website恢復，所以繪圖數據在文件中，它只是不完整。

有沒有其他方法可以恢復？也許添加一些文本到PDF文件（使用文本編輯器），使PDF文件是完整的？

Answer 1

我會建議提高橋或降低河流。也就是說，我會考慮兩種可能的修正之一，這取決於你在做什麼（這裏沒有很多細節，所以我正在做它）：您的循環的每次迭代都是一項完整的任務，以防萬一它在牆壁時間到期之前成爲最後一個循環，或者調整循環計數或wallclock限制以更頻繁地完成作業。

如果你不能改變你的循環計數或walltime，看看是否讓每個迭代追加到前一個，所以任何循環具有完整的輸出端，你可以修改你的循環過程，因而也無所謂是否接下來會有另一個迭代。否則，要麼將循環限制降低到某些可以可靠完成的計數（例如200或250），要麼將您的walltime限制延長到某個值，以便在正常系統負載下完成任務。現在你正在把自己置於一個困難的地方;一個或另一個將不得不移動。