如何解決R Markdown（針織）「'關閉'不可子集」？

我想首次使用RMarkdown（針織）生成PDF。默認文件（File> New File> R Markdown）運行良好，它顯示編譯時生成的pdf。例如，下面的代碼運行，如何解決R Markdown（針織）「'關閉'不可子集」？

```{r cars} 
summary(cars) 
```

但是，如果我只是改變了汽車「myData的，」它沒有編譯和表演，

Error in object[[i]] : object of type 'closure' is not subsettable 
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> summary -> summary.default 
Execution halted

我有「myData的」裝在全球環境，並可以在原始R腳本中執行其他操作。有人可以提供一些指導。非常感謝您的寶貴時間。

來源

2016-06-21 Droid-Bird

我認爲你的數據'myData'不適用於'summary（）'。嘗試'print（myData）'而不是'summary（myData）'，你會在你的PDF中得到一些結果。 –

嗨，謝謝，但它沒有奏效。 Summary（）停止了編譯，print（）打印了pdf但不打印myData摘要。它打印幾個功能，元數據等。謝謝。 –

好吧，'knit'默認不會使用全球環境，所以這是您的主要問題。 – hrbrmstr

運行Rmarkdown文件開始一個新的R會話。

在新會話中，您可以加載存儲在data包中的data.frames，但其他數據集必須從Rmarkdown文檔中加載。

要獲得的myData您Rmarkdown文檔中顯示，

與save某個文件中保存您的當前R會議
那麼你Rmarkdown文檔中，使用load開拓數據集

所以，在當前的R對話：

save(myData, file="<path>/myData.R")

，並在您Rmarkdown文件：

```{r myDataSummary} 
load("<path>/myData.R") 
summary(myData) 
```

如果您的數據存儲爲文本文件，並且不希望保存一個獨立的.R文件，您Rmarkdown文件中直接使用read.csv或朋友。

```{r myDataSummary} 
myData <- read.csv(<path>) 
summary(myData) 
```

來源

2016-06-21 13:01:01 lmo

謝謝。這是解決方案。謝謝你的解釋，這更重要。我也在這裏添加了我的解決方案。 –

這是當你試圖子集（=通過x[i]）一功能你的錯誤。由於此錯誤是由代碼中的summary(cars)造成的，因此我們可能推測cars對象引用文檔所針對的範圍中的函數。

您可能忘記了加載數據，或者您有一個在當前範圍中定義的同名函數。

來源

2016-06-21 13:04:23

正如@Imo所解釋的，基本問題是新的會話。所以，答案是在rMarkdown中添加腳本。但是，它會造成更多的打嗝。下面是我如何處理其中的幾個，

```{r global_options, include=FALSE} 
source(file = "C:\\Path\\to\\my\\file.R") 
knitr::opts_chunk$set(fig.width=12, fig.height=8, fig.path='Figs/', 
         echo=FALSE, warning=FALSE, message=FALSE) 
```

來源

2016-06-21 13:39:15

如何解決R Markdown（針織）「'關閉'不可子集」？

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