在Linux上通過Rpy運行時發生R段錯誤

Question

我在redhat linux發行版上通過Rpy運行R。定期我會遇到這個錯誤信息：

*** caught segfault *** 
address (nil), cause 'unknown' 

而整個程序就在那裏死去。它通常發生在我運行大量回歸r.lm()時。但通過再次運行相同的代碼，問題可能會或可能不會消失（所以不總是可重現的）。有誰知道什麼可能導致這種情況，和/或我怎麼能阻止它發生？

Answer 1

有幾種可能性。

1. 問題出在R代碼上。爲了測試這個，運行R中的代碼，看看你是否可以複製這個問題。

2. 問題出在Rpy上。在調試器中運行程序，看看你從Python傳遞到R以及從R傳遞到Python。猜測，你有某種只在某些條件下才會出現的變量不匹配。

3. 問題在於環境。是否需要加載一些其他軟件才能運行程序？當它再次運行時，一旦失敗，它會起作用嗎？ （也許你沒有關閉與文件的連接？）它在別人的機器上還是在你的機器上失敗？

4. 問題出在數據上。你是否隨機生成任何東西？這將解釋問題的間歇性。

如果您仍然卡住，請閱讀tips on debugging。