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報告R作爲錯誤崩潰

2011-06-28 78 views
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最近我經常崩潰R。該消息總是報告R作爲錯誤崩潰

*** caught segfault *** 
address xxx, cause 'memory not mapped'

重現將是艱難的，在任何情況下，我不能共享大型專有數據集。我的問題是：我能否報告墜機事故以便調查？生成coredump有幫助嗎？似乎關於報告錯誤的常見問題解答部分並不意味着這種意外情況。

來源

2011-06-28 gappy

+1

至少你應該添加sessionInfo（）到這個問題，並報告發生了什麼：你是從數據庫，文件，寫作等讀？ – mdsumner

+0

感謝所有回答。在segfault之後運行sessionInfo（）是不可能的。我的代碼使用了大量的包（RODBC，動物園，plyr，reshape，ggplot2），其中一些使用C（動物園，RODBC），或者大量調用C例程（ggplot，調用網格）。我想知道是否有可能確定違規包裹。 – gappy

+0

sessionInfo（）報告的類似內容會做，實際運行它沒有技術上的必要性，它只是一種超級懶惰的方式來提供基本信息，所以我想我們應該用一根實際的棒子來打敗你的頭。 – mdsumner

回答

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我不會將它們報告給R-core/R-devel，除非你100％確定它是R中的一個錯誤而不是一個包。這個錯誤更可能出現在你正在使用的軟件包中。如果你不能創建一個可重現的bug的例子，那麼軟件包維護者不太可能試圖追捕它。

來源

2011-06-28 20:25:02

+3

放大：首先找到一個可重現的例子（如有必要，創建一個批處理文件，多次運行相同的分析，直到發生崩潰）。然後縮小這種情況：您可以使用多少套可用的軟件包，但仍然會導致崩潰？你能用同樣大小的隨機，匿名或隨機數據來做到這一點嗎？ –

4

可以發生此錯誤消息

  1. 硬件過熱
  2. 基於R的或封裝的過期版本
  3. 在封裝
  4. 中的R中的一個錯誤的一個錯誤

直到你可以複製它，如果你不想公開你自己的數據，我懷疑有人會關注崩潰報告。

來源

2011-06-28 20:32:15 Henry

1

'內存未映射'文本導致強烈懷疑這是系統問題：操作系統，C庫或BLAS中的任何一個都可能處於危險之中。

大型計算機作業令人沮喪 - 但除此之外，沒有其他辦法可以將其提升爲一個可重複使用的最小例子，您也可以使用模擬數據來完成這一任務。

作爲一個開始，嘗試查看問題是否存在於不同的操作系統上，例如，嘗試在Mac或不同的linux風格或windoze上重新運行該問題。

來源

2011-06-30 08:48:00

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