使用linux命令修改列中的文本

Question

我有一個製表符分隔的文件，列如下所示。

chr1 899766 899766 G T exonic;exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV;nonsynonymous SNV 

我想在「;」之後刪除文本。在列6和9.輸出應該看起來像：

chr1 899766 899766 G T exonic KLHL17 . nonsynonymous SNV 

有人可以給一個Linux命令來解決這個問題。它應該刪除「;」後面的所有內容只在指定的列中。

Answer 1

您可以使用下面的命令sed：

sed 's/;[^\t]\+//g' your-log-file > new-file-name 

這意味着「一個分號後刪除一切達（但不包括）下一個標籤」。輸出將轉到new-file-name。如果你想編輯就地your-log-file（一旦你確定了命令的工作，你想讓它，你可以做以下的方式：

sed -i 's/;[^\t]\+//g' your-log-file 

您還可以使用awk，雖然我與不太熟悉的程序。這裏是一個簡要的概述：http://www.cyberciti.biz/faq/howto-delete-word-using-sed-under-unix-linux-bsd-appleosx/。