Gephi中的CSV導入

Question

我已經使用大型數據集中的R創建了我的網絡。我用一個較小的測試和寫我自己的繪圖儀，以顯示我想如何顯示，我似乎無法得到它的權利....

此圖顯示了我的網絡應該看起來如何。我已經嘗試了數據的平方矩陣（36x36）和1x36導出爲CSV，這兩者都沒有給出我想要的結果。

忽略較大的圓，我想上述圖像中顯示的網絡。

版本1 - 1x36 - https://www.dropbox.com/s/k4a7tc0kwlfqd0l/ABC.csv

版2 - 36X36 - https://www.dropbox.com/s/mmu7spix076bn6e/DEF.csv

的結構如下。第1行&第1列 - 節點名稱。所有數字決定是否存在邊緣（0或1）。

當我嘗試導入這些文件時，Gephi以一種不尋常的方式解釋它們。

有什麼我做錯了嗎？

乾杯

Answer 1

我建議你使用rgexf。它可在 http://cran.r-project.org/web/packages/rgexf/index.html

我假設你已經有一個邊界列表。讓我稱之爲x。

library(rgexf) 
data <- edge.list(x) # It creates two objects from your edgelist: data$nodes and data$edges 
g <- write.gexf(nodes=data$nodes,edges=data$edges,...) # It creates a graph in gexf format, here you can add nodes' attributes, edges' attributes, etc... 
print(g, file="mygraph.gexf") # It saves the graph 

欲瞭解更多詳情。手冊在這裏：http://cran.r-project.org/web/packages/rgexf/rgexf.pdf）