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balloon/balloon -f balloon/MMFF94.mff --nconfs 1 --nGenerations 300 "[H]OC(=O)C([H])([H])[[email protected]@]1([H])C2=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])OC3=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C(C([H])=C3[H])C3=NC(OC([H])([H])C([H])([H])[H])=C(S3)C([H])([H])[H])C([H])=C2C([H])([H])C1([H])[H]" AAA.pdb
它非常好。然而，當我嘗試實施使用IPython的，有錯誤，我的代碼如下：
import os
str3="[H]OC(=O)C([H])([H])[[email protected]@]1([H])C2=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])C([H]([H])C([H([H])OC3=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C(C([H])=C3[H])C3=NC(OC([H])([H])C([H])([H][H])=C(S3)C([H])([H])[H])C([H])=C2C([H])([H])C1([H])[H]"
str4="balloon/balloon -f balloon/MMFF94.mff --nconfs 1 --nGenerations 300 str3 AAC.pdb"
#os.system('balloon_options')
os.system(str4)
的錯誤是：■ 後語法錯誤：
無法解析輸入STR3 SMILES解析器說跳繩。
問題出在哪裏？
順便說，氣囊是能夠把SMILES字符串轉換成MOL2或PDB格式的軟件。（SMILES STRING就像[H] OC（= O）C（[H]）（[H]）[C @ @] 1（[H]）C 2 = C（[H]）C（[H]）= C（OC（[H]）（[H]）C（HC（[H（[H]）OC3 = C （OC（[H]）（[H]）[H]）C（[H]）= C（C（[H]）= C3 [H]）C3 = NC（OC（[H]）（[H ]）C（[H]）（[H] [H]）= C（S3）C（[H]）（[H]）[H]）C（[H]）= C2C（[H]）（ [H]），C1（[H]）[H]）