使用C＃進程運行可執行程序

我是一名生物信息學人員，我使用C＃進行工作。我一直在使用C＃中的進程來運行可執行程序幾次。這次我有一個新問題。我在Windows下載了一個名爲Blast的程序的exe文件（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download）。如果我輸入的命令是：使用C＃進程運行可執行程序

blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt

它工作正常。但是，當我複製粘貼命令從記事本它會給出錯誤。我搜索了這個問題，發現它是一個「編碼問題UTF-8與ISO-latin」（http://biostar.stackexchange.com/questions/7997/an-error-by-using-ncbi-blast-2-2-25-on-windows），這是由複製和粘貼導致的。

現在我想從c＃運行進程來調用exe文件，我得到了同樣的問題，我想這是因爲該進程做了類似於複製和粘貼的操作。這裏是我的代碼：

public void Calculate() 
    { 
     Process proc = new Process(); 
     proc.StartInfo.WorkingDirectory = Program.NCBIBlastDirectory; 
     proc.StartInfo.FileName = @"C:\Program Files\NCBI\blast-2.2.25+\bin\blastp.exe"; 
     proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt"; 
     proc.StartInfo.UseShellExecute = false; 
     proc.StartInfo.RedirectStandardError = true; 
     proc.StartInfo.RedirectStandardError = true; 
     proc.Start(); 
     proc.WaitForExit(); 
     proc.Close(); 
    }

你有什麼想法我可以解決這個問題嗎？

在此先感謝。

來源

2011-11-11 Reyhaneh

如果您已經從記事本中複製並粘貼了您的參數，那麼他們可能已經保留了編碼。使用notepade保存帶有ansi編碼的文本文件，然後複製這些參數。 – Kell

你確定你應該把「blastp」作爲參數中的第一個單詞嗎？那不是exe名字？該過程現在將調用此命令：C：\ Program Files \ NCBI \ blast-2.2.25 + \ bin \ blastp.exe blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt –

的一個問題，我可以看到的是在該行你設置參數：

proc.StartInfo.Arguments = "blastp -query input.txt -db pdbaa -out output.txt";

我想你的意思是：

proc.StartInfo.Arguments = "-query input.txt -db pdbaa -out output.txt";

所以你不需要再指定可執行文件名在參數中 - 這就是FileName的用途。

另一件事是，如果你不使用shell-execute來啓動它們，那麼有很多應用程序的行爲不太好。首先用shell-execute（顯然沒有重定向任何std *）嘗試它，如果它以這種方式工作，那麼你就會知道這個問題是什麼 - 儘管我擔心你可以做的不多。

另外，爲什麼是線

proc.StartInfo.RedirectStandardError = true;

重複兩次？

來源

2011-11-11 13:19:09 ShdNx

謝謝。是的問題出現在參數陳述中。我刪除了這個blastp，現在正在工作。 – Reyhaneh

使用C＃進程運行可執行程序

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