從RasterBrick提取某些座標的數據

Question

從this file我想提取某些座標的所有值。

所以我創建了一個RasterBrick：

library(raster) 
library(R.utils) 

rr <- gunzip("rr_0.25deg_reg_v12.0.nc.gz") 
rr <- brick(rr) 

> rr 
class  : RasterBrick 
dimensions : 201, 464, 93264, 23922 (nrow, ncol, ncell, nlayers) 
resolution : 0.25, 0.25 (x, y) 
extent  : -40.5, 75.5, 25.25, 75.5 (xmin, xmax, ymin, ymax) 
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
data source : C:\...\rr_0.25deg_reg_v12.0.nc 
names  : X1950.01.01, X1950.01.02, X1950.01.03, X1950.01.04, X1950.01.05, X1950.01.06, X1950.01.07, X1950.01.08, X1950.01.09, X1950.01.10, X1950.01.11, X1950.01.12, X1950.01.13, X1950.01.14, X1950.01.15, ... 
Date  : 1950-01-01, 2015-06-30 (min, max) 
varname  : rr 

現在我想提取所有值（每日precipiation從1950年1月1日至2015年6月30日）爲某個座標，例如LON 9.258157 LAT 47.70842

我試圖extract像這樣：

raster::extract(rr, cbind(9.258157, 47.70842), df = TRUE) 

在所得：

'data.frame': 1 obs. of 23923 variables: 
$ ID   : num 1 
$ X1950.01.01: num 0 
$ X1950.01.02: num 9.3 
$ X1950.01.03: num 4.2 
$ X1950.01.04: num 11.2 
$ X1950.01.05: num 0 
$ X1950.01.06: num 0 
$ X1950.01.07: num 0 
$ X1950.01.08: num 0 
$ X1950.01.09: num 0 
$ X1950.01.10: num 0 
... 

但我想與兩列（日期和值）作爲輸出的數據幀，所以我做了：

rr.plot <- t(raster::extract(rr, cbind(9.258157, 47.70842), df = TRUE)) 
rr.plot <- data.frame(Date = as.Date(substr(rownames(rr.plot), 2, 11), format = "%Y.%m.%d"), Prcp = rr.plot[,1])[-1,] 
rownames(rr.plot) <- 1:nrow(rr.plot) 

> head(rr.plot) 
     Date Prcp 
1 1950-01-01 0.0 
2 1950-01-02 9.3 
3 1950-01-03 4.2 
4 1950-01-04 11.2 
5 1950-01-05 0.0 
6 1950-01-06 0.0 

但我懷疑這是最好的方式去，必須有解決方案離子更直接？

Answer 1

如何使用tidyr::gather？

xy <- raster::extract(rr, cbind(9.258157, 47.70842), df = TRUE)[, 1:10] 

library(tidyr) 
xy 
    ID X1950.01.01 X1950.01.02 X1950.01.03 X1950.01.04 X1950.01.05 X1950.01.06 X1950.01.07 X1950.01.08 X1950.01.09 
1 1   0   9.3   4.2  11.2   0   0   0   0   0 

gather(xy[, -1], key = datum, value = Prcp) 
     datum Prcp 
1 X1950.01.01 0.0 
2 X1950.01.02 9.3 
3 X1950.01.03 4.2 
4 X1950.01.04 11.2 
5 X1950.01.05 0.0 
6 X1950.01.06 0.0 
7 X1950.01.07 0.0 
8 X1950.01.08 0.0 
9 X1950.01.09 0.0