矩陣對象沒有屬性節點networkX python

我試圖用連接的組件表示一些數字作爲圖的邊。爲此，我一直在使用python的networkX模塊。
我的圖是G，並具有初始化節點和邊如下：矩陣對象沒有屬性節點networkX python

G = nx.Graph() 
    for (x,y) in my_set: 
     G.add_edge(x,y) 

    print G.nodes() #This prints all the nodes 
    print G.edges() #Prints all the edges as tuples 
    adj_matrix = nx.to_numpy_matrix(G)

一旦我添加以下行，

pos = nx.spring_layout(adj_matrix)

我得到上述錯誤。如果它可能有用，所有節點的編號都是9-15位。有412個節點和422個邊緣。

詳細的出錯：

 File "pyjson.py", line 89, in <module> 
     mainevent()   
     File "pyjson.py", line 60, in mainevent 
     pos = nx.spring_layout(adj_matrix) 
     File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx/drawing/layout.py", line 244, in fruchterman_reingold_layout 
     A=nx.to_numpy_matrix(G,weight=weight) 
     File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx/convert_matrix.py", line 128, in to_numpy_matrix 
     nodelist = G.nodes() 
     AttributeError: 'matrix' object has no attribute 'nodes'

編輯：下面解決。有用的信息：pos爲每個節點創建一個帶有座標的字典。做nx.draw（G，pos）創建一個pylab圖。但它不顯示它，因爲pylab不會自動顯示。

來源

2015-05-18 tvishwa107

不清楚你在這裏嘗試的是什麼['spring_layout']（https://networkx.github.io/documentation/latest/reference/generated/networkx.drawing.layout.spring_layout.html）將圖形作爲第一個param，不是矩陣數組 – EdChum

@EdChum：我不知道，謝謝。我如何才能讓圖形顯示出來？ nx.draw（G）不會拋出任何錯誤，但它也不會出現。 – tvishwa107

'sprint_layout'返回節點位置，您需要將此傳遞給'nx.draw'，所以'nx.draw（G，nx.spring_layout（G））'會起作用，我可以發佈一個示例 – EdChum

（一些這個答案在您的意見解決了一些東西，你可以添加這些到您的以便後來的用戶獲得更多的上下文）

pos創建一個帶有座標的字典爲每個節點添加一個。做nx.draw(G,pos)創建一個pylab圖。但它不顯示它，因爲pylab不會自動顯示。

import networkx as nx 
import pylab as py 

G = nx.Graph() 
for (x,y) in my_set: 
    G.add_edge(x,y) 

print G.nodes() #This prints all the nodes 
print G.edges() #Prints all the edges as tuples 
pos = nx.spring_layout(G) 
nx.draw(G,pos) 
py.show() # or py.savefig('graph.pdf') if you want to create a pdf, 
      # similarly for png or other file types

最後的py.show()會顯示出來。 py.savefig('filename.extension')將根據您用於extension的內容保存爲多個文件類型中的任意一種。

來源

2015-05-18 22:09:28 Joel

spring_layout需要一個網絡圖，因爲它是第一個參數，而不是一個numpy數組。它返回的是根據Fruchterman-Reingold力定向算法的節點位置。

所以，你需要這個傳遞給draw例如：

import networkx as nx 
%matplotlib inline 
G=nx.lollipop_graph(14, 3) 
nx.draw(G,nx.spring_layout(G))

產量：

enter image description here

來源

2015-05-18 19:00:31 EdChum

我試過了，是否需要包含nx.lollipop_graph部分？雖然沒有錯誤發生，但我的程序實際上並沒有顯示圖形。編輯：有一次，我添加了一個節目 – tvishwa107

棒棒糖圖只是一個圖形發生器，我不知道你想要構建什麼圖，但我認爲這將演示它如何工作以及它是如何顯示的。如果我的答案完全解決了您的問題，請接受它，答案左上角會出現一個空的勾號，謝謝 – EdChum

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