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就R控制檯中,我可以看到系統2()的輸出:knitr未能打印出系統2()輸出
> STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
> system2(STAR,'--version')
STAR_2.5.2b
但是,當我有一個.Rnw一個塊文件等這樣的:
\begin{frame}[fragile]{Global STAR settings}
<<echo=TRUE, results="asis">>=
STAR<-'/opt/NGS/STAR/STAR-2.5.2b/bin/Linux_x86_64_static/STAR'
system2(STAR,'--version')
@
\end{frame}
它應該在頁面上打印出STAR_2.5.2b
,但沒有打印任何內容。有人知道爲什麼嗎?
嘗試設置'stdout = TRUE',即'system2(STAR,'version',stdout = TRUE')'。 –
感謝您的建議!它現在已經修復了。 –