R中的字符串操作

我有一個DNA序列列表，例如「AGAACCTTATTGGGTCAAGT」。如果我想創建一個包含所有可能的字符串的列表，這些字符串可以按照給定長度的順序（例如4）順序地發生，那麼在R中該怎麼做？R中的字符串操作

在這種情況下，第一個字符串將是「AGAA」。第二個是「GAAC」，第三個是「AACC」，等等。

2017-04-20 user1294476

查找生成排列。 – Carcigenicate

x = "AGAACCTTATTGGGTCAAGT" 
sapply(1:(nchar(x)-3), function(i) substr(x, i, i+3)) 
#[1] "AGAA" "GAAC" "AACC" "ACCT" "CCTT" "CTTA" "TTAT" "TATT" "ATTG" "TTGG" "TGGG" "GGGT" "GGTC" "GTCA" "TCAA" "CAAG" "AAGT"

來源

2017-04-20 16:51:49

謝謝！如果序列在一個大列表中，首先取消列表然後使用sapply或通過每個列表元素使用for語句會更有效嗎？ – user1294476

R中的字符串操作

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