如何用tsv替換tsv中的空字符串？

Question

我有TSV的文件1，該結構如下：

col1 col2 col3 
1  4  3 
22 0  8 
3   5 

所以，最後一行看起來像3\t\t5，如果它被打印出來。我想用'NA'替換空字符串，以便該行將是3\tNA\t5。使用命令行執行此操作的最簡單方法是什麼？

Answer 1

AWK是專爲這種情況（其中一百萬人;-)）

awk -F"\t" -v OFS="\t" '{ 
     for (i=1;i<=NF;i++) { 
     if ($i == "") $i="NA" 
     } 
     print $0 
}' file > file.new && mv file.new file 

-F="\t"表示字段分隔符（也稱爲FS內部到awk）是製表符。我們還將輸出字段分隔符(OFS)設置爲"\t"。

NF是一行數據上的字段數。 $i對於1到NF之間的每個值都被評估爲$1, $2, $3, ...。

我們測試$i th元素是否爲空，if ($i == "")以及它是什麼時，我們將$i th元素更改爲包含字符串「NA」。

對於每一行輸入，我們打印行的（$0）值。

在awk腳本之外，我們將輸出寫入臨時文件，即file > file.new。 &&測試awk腳本沒有錯誤退出，如果正常，則將file.new移動到原始文件上。根據您的項目需要的安全和安全用例，您可能不想「破壞」您的原始文件。 IHD。

IHTH。

Answer 2

直接的方法是在地方

sed -i 's/^\t/NA\t/;s/\t$/\tNA/;:0 s/\t\t/\tNA\t/;t0' file 

• sed -i編輯文件;

• s/a/b/替換a與b;

• s/^\t/\tNA/在該行的開頭NA\t （第一列成爲NA）替換\t;

• s/\t$/\tNA/最後一欄相同;

• s/\t\t/\tNA\t/ insert NA in \t\t;

• :0 s///; t0重複s///如果有替換（如果有其他缺失值在行中）。