圖的不同部分的顏色可視化

我在植物根部的不同部分有一些基因表達數據（參見圖像），我想顯示根部不同部分的基因表達水平。例如，如果基因在頂端分生組織中高度表達，我想標記紅色示意圖的頂端分生組織部分。一種可能性是將圖表製作成地圖，有沒有人有任何建議如何在R中製作地圖圖表？或者，如果您知道有任何工具可用於此目的，請告訴我。謝謝！圖的不同部分的顏色可視化

The plant root structure

來源

2016-06-08 l0110

SO只接受柵格圖像文件，但如果您的原件具有實際結構，則可以爲單獨的多邊形着色。 –

你可以自己繪製多邊形使用the raster package分離的區域。或者，this post可能提供了一個更好的方法來做到這一點。

然後，您可以在多邊形內創建熱圖和顏色。說，與ggplot2::geom_polygon()

，使它看起來更好，你可以使用原始圖像作爲背景，然後用一些透明度（即alpha論點ggplot2）覆蓋的熱圖，所以你可以看到彩色熱圖和一些原始圖像。如果您喜歡有趣的圖片，請參閱this post或this post

來源

2016-06-08 18:08:20 BarkleyBG

非常感謝，BarkelyBG！由於我有一個SVG格式的文件，因此人體帖子是我需要的。 – l0110

圖的不同部分的顏色可視化

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