Python中的新增功能：GLPK無法正確構建/ Python ImportError

Question

這是一個初學者問題，並且是this one的後續處理，我指的是GLPK。

我試圖獲得PyGLPK，這是一個啓動並運行的GNU Linear Programming Kit的Python綁定，但無論我做什麼，我似乎都無法構建和安裝GLPK，以便Python能夠正確地找到它。這是在GLPK庫上運行./configure，make和sudo make install之後進行的，並遵循PyGLPK的說明。

具體而言，這裏是我的錯誤：

>>> import glpk 
Traceback (most recent call last): 
File "<stdin>", line 1, in <module> 
ImportError: dlopen(/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site- packages/glpk.so, 2): Symbol not found: __glp_lpx_print_ips 
    Referenced from:  /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/glpk.so 
    Expected in: dynamic lookup 

我以爲自己是不是鏈接到別的地方，那它可能有事情做與路徑和環境變量。但是，這裏是我在shell中的能力失敗的地方，而且我對下一步該做什麼感到不知所措。

編輯

1. 我能夠在命令行中運行GLPK求解器（glpsol），所以我知道它的工作原理，至少在理論上。

2. 有一次我嘗試使用MacPorts安裝GLPK的一個版本。我已經卸載了這個版本，雖然使用MacPorts。

3. 下面是使用otool -L，這顯然是OS X答案ldd結果：

   /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/glpk.so: 
   /usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 88.3.11) 
   

再次，有可能是一個簡單的答案，但我還沒有任何谷歌使用我知道的術語運氣。

Answer 1

問題解決了！

托馬斯·沃特的第一個建議是最接近的標記：在glpk.so模塊沒有鏈接到C庫都沒有。其原因是，使用make和gcc4.2指定64位體系結構，而Python的distutils模塊上使用gcc-4.0與32位架構構建PyGLPK的源代碼堅持原始GLPK庫構建。

由於我不知道如何將編譯器標誌添加到distutils，我只是重建了GLPK庫，強制distutils編譯器標誌。這是最後的工作。

這似乎是與OS X 10.6的問題。 ./configure腳本查詢系統架構，我認爲這是默認的x86_64，即使Python 2.6在32位二進制文​​件中播放效果最好。

Answer 2

這個問題並不是真的特定於Python。 glpk模塊是一個擴展模塊，Python加載的C共享庫。該C共享庫依賴於它封裝的GLPK C庫;加載擴展模塊應加載GLPK C庫，以便擴展模塊可引用來自GLPK C庫的符號，如__glp_lpx_print_ips。顯然，有些失敗。這可能是幾件事情之一：

1. 的glpk.so擴展模塊可能不會對GLPK C庫的所有鏈接。這意味着它的構建不需要鏈接到GLPK庫所需的參數-l，這意味着問題出在glpk擴展模塊的構建過程中。您可以通過使用ldd工具來判斷glpk.so是否依賴於C庫。例如：

   % ldd /usr/lib/python2.6/lib-dynload/gdbm.so 
   linux-gate.so.1 => (0xb77bb000) 
   libgdbm.so.3 => /usr/lib/libgdbm.so.3 (0xb7799000) 
   libpthread.so.0 => /lib/i686/cmov/libpthread.so.0 (0xb7780000) 
   libc.so.6 => /lib/i686/cmov/libc.so.6 (0xb7639000) 
   /lib/ld-linux.so.2 (0xb77bc000) 
   

   這顯示我的gdbm擴展模塊靠在libgdbm共享庫鏈接

2. 的glpk.so擴展模塊可針對GLPK C庫被鏈接（以及那些其他共享庫。）正確，但動態鏈接程序可能無法找到C庫。通常這會產生一個不同的警告（關於不能找到C庫），但這可能不會發生在MacOS上。您可以通過再次使用ldd工具來看到這一點：它將列出依賴項，但不會顯示加載的實際文件（它會顯示「未找到」）。

   這通常是由於未安裝C庫，或者將它安裝在動態鏈接程序不知道看的地方。不幸的是，我不知道MacOS X如何執行它的庫查找，以及如何修改它掃描的路徑。 （在大多數UNIX系統中你會編輯/etc/ld.so.conf或/etc/ld.so.conf.d/一個文件中，或運行ldconfig -m）

3. 的glpk.so擴展模塊可以正確連接，動態連接器可以找到正確的模塊，但GLPK擴展模塊畢竟可能不會定義這個符號。這可能是在GLPK中的錯誤，也可能是因爲動態連接器是找到一個不同 GLPK C庫（不同的版本，或者一個是不同的內置），也可能是因爲GLPK C庫是不同的編譯比glpk.so擴展模塊。但是，這有點難以診斷，因爲這意味着要深入研究編譯過程中使用的實際C庫符號和頭文件。

我猜想，所有的事情都考慮到了，問題是＃2。這是最常見的問題，特別是在/usr/local中安裝時，這通常是./configure而沒有--prefix參數。