從wordpress安裝運行exec（）Rscript

目標： 從wordpress頁面運行簡單的Rscript。從wordpress安裝運行exec（）Rscript

我目前正試圖在加載頁面時使用exec（）來運行Rscript。該腳本創建從整數1到10的100個隨機樣本的直方圖，將系統時間寫入標題並將圖保存爲.png文件。

設置：

運行的WordPress安裝在Ubuntu EC2微實例
R已經被成功地安裝和通過ssh
使用Exec的-PHP WordPress插件使得PHP代碼可以測試寫入並執行（測試成功）

PHP代碼（WordPress的頁內）

<?php 
    echo "This is the Exec-PHP 'Hello World'\n"; 
    echo exec("date"); 
    ?> 

    <?php 
    exec("Rscript <PATH>/test.R"); 
    ?> 

    <img src="<Image Location>/samplePlot.png" alt="" title="Sample R" />

RSCRIPT - test.R

png("<Image Location>/samplePlot.png") 
    hist(sample(1:10, 100, replace = TRUE), main= Sys.time(), lwd = 5) 
    dev.off()

圖像文件加載，但它沒有更新，說明RSCRIPT從來沒有被執行。我已經將它歸結爲這個問題，但不確定這是爲什麼。

我該如何調試？我真的不知道任何PHP的，但我試過如下：

<?php 
    exec("\usr\bin\Rscript <PATH>/test.R", $output, $result); 
    echo $output; 
    echo $result 
    ?>

將返回：

Array2

我希望得到的命令行輸出來檢查錯誤。這可能嗎？

來源

2011-12-12 bnjmn

它按預期從命令行工作嗎？ r腳本需要多長時間才能運行 – 2011-12-12 22:55:27

當我以普通用戶的身份登錄時，它確實有效。該腳本執行得非常快。這可能是一個權限問題嗎？無法寫入？我將如何檢查這個？我無法從php exec（）調用獲取任何輸出。 – bnjmn

我猜腳本運行時，HTML發送給用戶，所以他們下載舊版本的情節，而它正在更新 – hadley

我認爲問題在於你沒有指定完整路徑到Rscript，運行PHP/Apache的用戶只是不知道在哪裏搜索它。

更新exec命令一樣（在Linux上）：

exec("/usr/bin/Rscript <PATH>/test.R");

無論如何，我會建議供以後和（基於這樣）任務安裝littler爲讓事情捉迷藏r而不是Rscript運行速度快了很多 - 如果安裝例如。 rApache不是一個選項。

來源

2011-12-12 23:11:02 daroczig

我最初使用完整的路徑，並有相同的結果。在此期間，我會考慮小問題。 – bnjmn

你有安裝/配置的apparmor或類似嗎？嘗試從命令行以webserver用戶的名義運行'Rcript'。 – daroczig

要得到這個問題的嘗試的想法：

$e = exec("\usr\bin\Rscript <PATH>/test.R 2>&1"); 
var_dump($e);

如果你喜歡的東西：在dyn.load錯誤（文件的DLLPath = DllPath的，...）... 你可能需要更新服務器動態庫（嘗試搜索libfreetype。dylib），或者如果你正在運行MAMP（因爲我），你需要評論（＃）這兩個未註釋的行：/ Applications/MAMP/Library/bin/envvars

我知道你已經很長時間這個問題，但我花了很多時間與類似的問題 - 希望有人可以節省一些時間;）

來源

2012-11-05 01:40:13 seb5s

雖然對於原始問題（引用在Ubuntu中運行，而不是在Mac OS X中）並沒有真正的相關性，但我必須說 - 這結束了長達一小時的搜索，讓我感到沮喪。即使修改了庫文件的所有權，我也永遠無法讓MAMP甚至包括核心庫（如統計信息），儘管它會加載RJSONIO。奇怪的。無論如何，評論這些行允許MAMP執行R腳本來查找它以前沒有發現的dylib，這可能是包類統計信息的依賴關係。感謝分享！ –

從wordpress安裝運行exec（）Rscript

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