如何在unix中設置「module」命令來將軟件包添加到$ PATH中？

我使用了很多計算集羣，這些集羣通常使用模塊系統來製作軟件包。基本上，您使用模塊命令，如module load sample_software和sample_software路徑被添加到$PATH。在羣集中，可以在交互式使用和作業提交使用期間調用此命令。

我有一個安裝了PBS/Torque排隊系統的Linux盒子，這樣我就可以在沙盒中使用軟件，以便以後在集羣上使用。在這個盒子上我需要一個非常類似的模塊系統。我開始製作我的`/etc/profile.d/在目錄中稱爲modules.sh文件看起來像這樣：

module() 
{ 
if [ $2 == "softwareX" ]; then 
    PATH=$PATH:/home/me/dir/softwareX 
    export PATH 
fi 
}

我然後把下面一行在我.bash_profile腳本：

source /etc/profile.d/modules.sh

現在，這對於下列用途非常有用：1）如果我提交了一份工作，而且我的工作腳本使用了module load softwareX，沒有問題，工作完美無缺。 2）如果我在命令行上交互式地工作，並輸入module load softwareX，那麼通往softwareX的路徑將加載到我的$PATH中，並且一切正常。

但是，這不適用於以下情況：如果我製作一個簡單的bash腳本，其中包含行module load softwareX，執行bash腳本時出現錯誤。例如，這裏是我的bash腳本：

#!/usr/bin/env bash 
echo $PATH 
module load softwareX 
echo $PATH

當我執行此我收到錯誤script.sh: line 3L module: command not found

...和$PATH永遠不會改變。有沒有人知道我可以如何解決這個問題在所有三種情況下工作？謝謝你的幫助！

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2014-02-07 jake9115

bash腳本不會調用你的啓動文件。你必須明確地做到這一點。

見http://www.gnu.org/software/bash/manual/bashref.html#Bash-Startup-Files

調用非交互
當bash啓動非交互，運行shell腳本，例如，它會在環境變量BASH_ENV，擴大它的值，如果它出現在那裏，並使用擴展值作爲文件的名稱來讀取和執行。擊的行爲就好像被執行以下命令：
if [ -n "$BASH_ENV" ]; then . "$BASH_ENV"; fi 
但PATH變量的值不被用於搜索的文件名。

如上所述，如果使用--login選項調用非交互式shell，Bash會嘗試從登錄shell啓動文件讀取並執行命令。

來源

2014-02-07 15:33:23

當您創建一個子shell時，您將創建一個新的環境。當你退回到你現有的shell中時，你會失去這個環境。

我懷疑這是你的模塊函數調用發生了什麼。如果您將echo $PATH添加到模塊函數的底部，您是否看到PATH在函數內部發生變化，但在離開函數時會再次發生變化？如果是這樣，問題是一個子shell的問題：

你應該做的是有你的模塊功能，打印出來的新路徑，然後做到這一點：

PATH=$(module load softwareX)

來源

2014-02-07 15:20:33

如何在unix中設置「module」命令來將軟件包添加到$ PATH中？

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