2017-04-26 31 views
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我使用的包FactoMiner和其功能HCPC之間的差異。然後我用的功能plot.HCPC(),我觀察到的(兩種選擇出相同的結果...)HCPC r功能 - 爲了創造一些觀察的分段簇數據和集羣的可視化

library(FactoMineR) data(USArrests) pca <- PCA(USArrests, ncp = 3, graph = FALSE) hcpc <- HCPC(pca, graph = FALSE)

這個函數有兩種選擇之間的差異。如果我用choice = 'map',我們看到即阿肯色州是在綠色羣集,但如果我使用choice = 'tree',阿肯色州是在紅色的羣集! (綠色集羣的其他狀態的綠色集羣中遠離地圖到樹狀/樹):

plot(hcpc, choice = 'map') plot(hcpc, choice = 'tree')

enter image description here

根據該數字結果(hcpc$data.clust),有在cluster3 8個觀測(綠色羣集),它與'地圖'可視化(但不是樹狀圖/樹可視化)相匹配。 如果我錯過了一些重要的東西,你知道我做錯了嗎?

回答

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在HCPC函數的第一個參數中的一個是康壽= T:

康壽一個布爾值。如果爲TRUE,則執行k-means合併 (如果使用kk且等於數字,則不能執行合併)。

library(FactoMineR) 
data(USArrests) 
pca <- PCA(USArrests, ncp = 3, graph = FALSE) 
hcpc <- HCPC(res.pca,consol=F, graph = FALSE) 
plot(hcpc, choice = 'map') 
plot(hcpc, choice = 'tree') 

factor map

tree

希望這將有助於你