c數組結構的cython內存視圖

我想用cython從一些二進制文件中提取數據，但是我遇到了一個問題，我對cython/c的知識無法解決它。c數組結構的cython內存視圖

問題：試圖對我的c數組結構進行內存視圖導致分段錯誤。

我在做什麼：我有一個充滿數據的二進制文件，第一個條目是一個無符號整數，給出文件中包含的快照數量（Snapshot_Counter）。下一個條目採用Snapshot_Information格式，並且此塊重複執行Snapshot_Counter次。如果我在循環中逐塊讀取它，將結果存儲在它的工作列表中，並獲得正確的數字。

我想通過一次讀取數組來避免這個循環。我想提取Snapshot_Information格式信息到一個數組中，我想我已經設法正確地分配。然而，我不知道如何查看數組，以檢查是否有正確的數據。我覺得這是錯誤的，因爲我在這個塊之後提取的數字是錯誤的。我想知道：我怎樣才能看到這個數組與內存視圖？我是否正確地分配內存？有沒有一個C數組做這個的另一種方法？

代碼：

in extractiontest.pxd 

cdef unsigned int Snapshot_Counter 

cdef packed struct Snapshot_Information: 
    signed int Days 
    unsigned int Seconds 
    ...more type definitions. 


in extractiontest.pyx 

rm = fopen("/filepath") 

fread(&Snapshot_Counter,4,1,rm) #works fine 
cdef Snapshot_Information *snap_info_array = <Snapshot_Information *>malloc(Snapshot_Counter*sizeof(Snapshot_Information)) 
fread(&snap_info_array, sizeof(Snapshot_Information), Snapshot_Counter, rm) 

cdef Snapshot_Information[:] snap_arr_view = <Snapshot_Information[:-1]>snap_info_array

來源

2016-12-08 R Davies

你要告訴它的長度：它不能從一個malloced陣列制定出一個長度：

cdef Snapshot_Information[:] snap_arr_view = <Snapshot_Information[:Snapshot_Counter]>snap_info_array

我懷疑它解釋爲-1一個巨大的正整數（因此分段故障）

仔細一看，你也有ano療法在你的代碼的bug：

fread(<void*>snap_info_array, sizeof(Snapshot_Information), Snapshot_Counter, rm)

我已經在前面snap_info_array取出&，並添加了強制轉換爲void*（我不知道，如果你需要投雖然）。您正在告訴fread寫入數組地址的地方，而不是數組。

來源

2016-12-08 14:37:39 DavidW

感謝DavidW，我設法讓它提取memoryview，然後使用np.asarray（snap_array_view）我可以看到它是Snapshot_Counter長。可悲的是，如果我嘗試打印它，我會遇到一個seg故障！所以我懷疑我沒有達到問題的底部。 –

@RDavies請參閱編輯。我不想承諾這是唯一的其他問題，但它確實是一個問題 – DavidW

優秀，似乎已經修復它。我是新來的指針/地址的東西。謝謝你的明確解釋。它與一起工作，數組名前面沒有任何內容。 –

c數組結構的cython內存視圖

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