2015-07-12 105 views
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我無法使用brentq函數迭代數組中的每個元素。下面定義的函數中的q是一個FITS文件數組,我們使用該數組中的每個元素作爲輸入來運行brentq函數,以便解決T使用brentq函數在Python中迭代數組函數

本質上,我的問題在於不是特別知道在何處或如何實現合適的for循環來迭代函數遍歷每個元素q

有關如何解決此問題的任何建議?

def f(T,q,coeff1,coeff2,coeff3): 
    return q*const3 - ((exp(const2/T)-1)/(exp(const/T)-1)) 

a = brentq(f, 10, 435.1, args=(q,4351.041,4262.570,0.206)) 
print a 

newhdu = fits.PrimaryHDU(a) 
newhdulist = fits.HDUList([newhdu]) 
newhdulist.writeto('Temp21DCOT.fits') 

進一步解釋:的我想要做的基礎是使用brentq解決使用我們的初始陣列的強度值(FITS我們的文件)的溫度值。

該方程由普朗克方程的兩個波長的比率推導出來,所以如果我們想要真實物理,q中的每個元素都是強度值,則爲q = B_1/B_2brentq將爲q中的每個元素解決T(溫度)的分析上不可解的方程,並製作與q相同尺寸的新溫度陣列。換句話說,我試圖使用普朗克方程來解決FITS文件中每個像素的溫度問題。

注:我重新發布了這個以更有效的方式闡明問題。

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函數參數名稱與''''f'''的*返回表達式*中的變量名稱不匹配。你使用'''scipy.optimize.brentq'''嗎? – wwii

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是的,確切地說。我導入scipy.optimize作爲brentq。 – Wolfgang

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你的函數需要5個參數。你在'''brentq''''''args'''參數中傳遞了4個值 - 在你的例子中它看起來像*'''fq''' *你問的是如何迭代一個數組並替換'''args中的那個(1,4351.041 ...這個例子中的值來自數組的值嗎? – wwii

回答

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您是否遇到迭代問題或效率問題?

這種迭代工作對我來說:

In [485]: from scipy import optimize 

In [486]: def f(T,q,coeff1,coeff2,coeff3): 
     return q*coeff3 - ((np.exp(coeff2/T)-1)/(np.exp(coeff1/T)-1)) 
     # corrected the coeff use 

In [487]: q=np.linspace(1,3,10) 
# q range chosen to avoid the different signs ValueError 

In [488]: A=[optimize.brentq(f, 10, 435.1, args=(i,4351.041,4262.570,0.206),full_output=True) for i in q] 

In [489]: A 
Out[489]: 
[(55.99858839149886, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861284c>), 
(64.14621536172528, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861286c>), 
(72.98658083834341, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861288c>), 
(82.75638321495505, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa86128ac>), 
(93.73016750496367, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa86128cc>), 
(106.25045004489637, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa86128ec>), 
(120.76612665626851, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861290c>), 
(137.88917389176325, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861292c>), 
(158.4854607193551, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861294c>), 
(183.82941862839408, <scipy.optimize.zeros.RootResults at 0xa861296c>)] 

In [490]: [a[1].iterations for a in A] 
Out[490]: [8, 9, 10, 10, 10, 10, 10, 9, 8, 10] 

brentq文檔f返回一個值,一組args。有一些求解器(如ode)可讓您定義一個函數,該函數使用矢量變量並返回匹配的矢量導數。它看起來不像這個根發現者允許的。所以你堅持迭代args值,並解決每個案例。我把這個迭代寫成列表理解。其他迭代格式是可能的(for循環等)。我們甚至可以將這個brentq調用包含在可以通過np.vectorize傳遞的函數中。但這仍然是一個小節省時間的迭代。


有多種處理多維數組的方法。一個簡單的方法是輸入flatten,執行1d迭代,然後重新調整結果。例如:

In [517]: q1=q.reshape(2,5) 

In [518]: q1 
Out[518]: 
array([[ 1.  , 1.22222222, 1.44444444, 1.66666667, 1.88888889], 
     [ 2.11111111, 2.33333333, 2.55555556, 2.77777778, 3.  ]]) 

In [519]: np.array([optimize.brentq(f, 10, 435.1, args=(i,4351.041,4262.570,0.206)) for i in q1.flat]).reshape(q1.shape) 
Out[519]: 
array([[ 55.99858839, 64.14621536, 72.98658084, 82.75638321, 
      93.7301675 ], 
     [ 106.25045004, 120.76612666, 137.88917389, 158.48546072, 
     183.82941863]]) 

我忘了full_output標誌,因爲這增加了複雜性。

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這是否與二維數組中的程序相同?因爲不幸的是'q'就是這樣。 – Wolfgang

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我添加了一個2d的例子 – hpaulj

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甚至'''...我在np.nditer(q)....'''。 – wwii