當分析數據來自一個非常大的數據幀的2列時，在特定行中省略NA

我對R非常陌生，我很努力去理解如何以特定方式省略NA值。我有一個很大的數據框與多列（最多40）和行（最多200ish）。我想使用其中一列的數據來做簡單的統計（wilcox.test，boxplot等）：一列有連續變量（V1），而另一列有二進制變量（V2; 0或1），其中分爲2組。我想爲連續變量使用不相關的不同V2二進制變量做到這一點。我在Excel中組織這些數據，將其保存爲CSV並使用R Studio。當分析數據來自一個非常大的數據幀的2列時，在特定行中省略NA

所有這些列都有散佈的NA值，而且當我使用omit.na時，它會將NA值存在的每一行都取下，這會消除可怕的數據負載。有沒有簡單的解決方案來做到這一點？我已經看到類似主題的一些答案，但沒有一個看起來完全是我需要做的。

非常感謝您的任何答案。再次，我是R的寶貝級新手，可能忽略了其他主題中的某些內容！

來源

2015-01-06 Miguel Ferreira

那麼你想要的輸出是什麼呢？你想要刪除一整行取決於只有在某些列而不是整個數據集的「NA」值？ –

大衛嗨！確切地說，我想省略每一個配對結果，也就是說，如果我在任何一行中只考慮兩列感興趣的列（V1和V2，比V1和V3等等），我想省略整行wilcox測試可以正常工作，而無需爲每對列創建單獨的CSV並在每個df中運行na.omit。非常感謝您的幫助！ –

您可以根據您喜歡的任何規則操作data.frame來省略。例如：

dirty.frame <- data.frame(col1 = c(1,2,3,4,5,6,7,NA,9,10), col2 = c(10, 9, 8, 7,6,5,4,3,2,1)) 
cleaned.frame <- dirty.frame[!is.na(dirty.frame$col1),]

此代碼使用is.na（）來測試特定列中的行是否爲na。！！意思不是，並且會省略那一行。

來源

2015-01-06 19:34:42 DG1

如果我明白了，您想每次都將功能應用於一對列。

wilcox.test(V1,V2) 
wilcox.test(V1,V3)...

其中Vi沒有缺失值。我會做這樣的事情：

## use complete.cases to assert that you have no missing values 
## for the selected pair 
apply_clean <- 
function(x,y){ 
     ok <- complete.cases(x, y) 
     wilcox.test(x[ok],dat$V1[ok]) 
} 
## apply this function to all columns after removing the continuous column 
lapply(subset(dat,select=-V1),apply_clean,y=dat$V1)

來源

2015-01-06 19:38:48 agstudy

嗨！感謝你的回答。我會嘗試這個並回發！ –

嗨，稍作澄清：如果我在V1和V2，V1和V3等等（V1是連續的，V2/3/etc是二進制的）工作（做wilcox，boxplot等），我會使用相同的V1，還是將na遺漏「堆棧」，即，當我在V1和V3上工作時，我只有NAs（V2）+ NAs（V3）而不是NAs（V3）？對不起，如果這聽起來很基本，但我仍然要抓住R.非常感謝！ –

另一個問題：V1也有NA值。對不起，不清楚。理想情況下，我實際上會有「多個」V1，即具有連續變量的若干列，然後在被「幾個」V2中的二進制組劃分時進行測試。 –

當分析數據來自一個非常大的數據幀的2列時，在特定行中省略NA

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