監視R中的內存使用情況

是否可以監視正在使用或已被R用來調用某個函數的內存量？例如，我有一個任意函數，e.g：監視R中的內存使用情況

smallest.sv <- function(){ 
    A <- matrix(rnorm(1e6), 1e3); 
    mysvd <- svd(A); 
    return(tail(mysvd$d, 1)); 
}

運行函數返回一個標量，而是使用了大量的內存來計算功能。現在我需要做性能基準測試。處理時間很簡單：

system.time(x <- smallest.sv())

不過，我也想知道有多少內存需要此調用，無需修改功能（它應該任意函數工作）。有沒有辦法做到這一點？

編輯：澄清一下。我最感興趣的是函數調用期間使用的內存上限，即需要多少物理內存來處理函數調用。在很多情況下，這大大低於我認爲分配的內存總量。

來源

2011-10-21 Jeroen

嗨Jeroen。你解決了這個問題嗎？你的解決方案是什麼？我也面臨這個問題。我希望監視函數調用期間使用的內存上限。 –

看看profvis：https://github.com/rstudio/profvis – Jeroen

謝謝，Jerson。我之前確實檢查過。但在我看來，軟件包僅用於分析代碼使用的時間。我沒有看到內存監控的功能。我在這裏錯過了什麼嗎？或者你能給我更多提示嗎？ –

ř提供存儲器分析支持，見Section 3.3 of the Writing R Extensions manual：

3.3內存使用仿形R代碼裏面

測量中的R代碼存儲器的使用是有用的任一當代碼發生更多的內存比方便可用或者當內存分配和對象的拷貝造成慢碼時。在R代碼中，有三種方法可以分析內存使用情況。所有這三個要求R到都已經用`--enable-memory-profiling'進行了編譯，這不是的默認值，但是當前用於Mac OS X和Windows二進制文件的發行版。由於不同的原因，所有這些都可能是誤導性的。

在理解內存配置文件時，瞭解有關R的內存分配的更多內容將有助於您進一步瞭解。查看'gc（）' 的結果，顯示了將內存劃分爲'Vcell'，用於存儲向量的內容和用於存儲其他所有內容的'Ncell'的內容，包括所有向量的管理開銷，例如type和長度信息。事實上，矢量內容被分成兩個池。用於小向量的內存（默認128字節或更少）在大塊中獲得，然後由R分出;直接從操作系統獲得的較大向量的內存爲。

然後再提供三個部分。

來源

2011-10-22 00:57:28

一個選項是使用Rprof。一個簡單的方法是：

Rprof(tf <- "rprof.log", memory.profiling=TRUE) 

[your code] 

Rprof(NULL) 
summaryRprof(tf)

這會給你一些關於內存使用情況的信息。

來源

2011-10-21 23:24:13 Ryogi

謝謝這很有用。但是，據我所知，Rprofmem記錄了所有已分配的內存，但它沒有考慮到垃圾收集？我最感興趣的是在處理函數期間使用的內存的上限。 – Jeroen

你可以使用你的操作系統的性能監視器。在手術前和讀者之後帶上讀者。在perfmon的Windows上 – SFun28

監視R中的內存使用情況

回答

3.3內存使用仿形R代碼裏面

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