sweave和ggplot2：完全沒有生成PDF

我想創建一個包含一些圖形與ggplot2完成的sweave報告。雖然我在尋找，從長遠來看一下環境 - 我只是用一個簡單的.Rnw此文件只包含的代碼，不幸的是，圖中未創建情節sweave和ggplot2：完全沒有生成PDF

\documentclass[a4paper]{article} 
\SweaveOpts{echo=FALSE} 
\usepackage{a4wide} 

    \begin{document} 

    \begin{figure}[htbp] 
    \begin{center} 
<<>>= 
library(ggplot2) 
x=rnorm(100) 
qplot(x) 

@ 
\caption{My Graph} 
\end{center} 
    \end{figure} 
\end{document}

，我只得到一個損壞的.PDF和.eps文件。雖然我得到一個很好的.tex文件，除了圖形外，它似乎可以正常工作。我用下面的基本代碼來創建它：

Sweave("myfile.Rnw")

我剛剛發現，在討論的透明度和sweave/GGPLOT2但沒有什麼可以幫助的問題在網絡上一些老的帖子。我也嘗試了輕鬆的包裝，這也沒有幫助。順便說一句，有沒有關於decumar包的消息？

來源

2010-07-21 Matt Bannert

Decumar在過去的幾天裏一直處於沉重的發展階段，實際上可能已經接近可以發佈的階段。 – hadley 2010-07-22 19:05:04

耶！這是我的一天。我真的很期待測試它！ – 2010-07-22 19:41:04

qplot()產生對象，而不是圖形輸出。它可能看起來就像它在運行時那樣，但是這是因爲沒有分配，R會自動打印qplot()的輸出。要將它集成到Sweave中，請將print()包裝在qplot()左右，或將qplot()的輸出分配給某個東西，然後將其包裝在print()中。

... 
<<fig = T, echo = F>>= 
library(ggplot2) 
x=rnorm(100) 
p <- qplot(x) 
print(p) 
@ 
...

這應該工作。我始終在我的sweave文檔中使用ggplot2圖形。

來源

2010-07-21 22:39:28 JoFrhwld

thx人。開始總是最難的......從來沒有想過這樣，因爲我之後只用了qplot（）和ggsave。 – 2010-07-21 23:40:37

你必須圍繞print()包裝它，使其工作在sweave。

來源

2010-07-22 18:29:20 Maiasaura

其實，雖然以前的答案都是正確的，但你的問題是另一回事。

您需要確保整個代碼塊位於頁面的左側（除函數中的Iundentation外）。再次，我不知道爲什麼，但這會給Sweave帶來問題。

確保所有代碼（以及代碼塊的頁眉/頁腳）位於頁面左側（並添加了打印語句）後，您的示例適用於我。順便說一句，我今天知道你可以在你的代碼中創建一個在sweave文檔中的環境（我沒有意識到這點，並且會爲我節省很多時間）。良好的舊的計算器，即使你回答一個問題，也能教會你新的東西！

希望這會有所幫助。

來源

2011-09-23 15:55:58 richiemorrisroe

sweave和ggplot2：完全沒有生成PDF

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