有誰知道如何從(工作)目錄導入/上傳PNG圖像到RStudio Notebook腳本?我喜歡將它包含在筆記本的HTML輸出中。 Rmarkdown中的建議腳本(http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_basics.html)在Notebook中不起作用。如何將圖像上傳到RStudio Notebook?
下面是一些代碼,我已經使用/創建:
#' Plot pathways using the bioconductor *pathview* package. Five *.png images are placed in the working directory by default.
>p <- pathview(gene.data=foldchanges, pathway.id=keggresids, species="hsa"))
>str(p)
的「STR(P)」的對數是(每個途徑的一種)的5列表中的每個由data.frame情節的.data.gene with 10 variables and a plot.data.cpd:NULL
可以使用路徑視圖小插曲的第3-6頁上的示例(https://www.bioconductor.org/packages/3.3/bioc/vignettes/pathview/inst/doc/pathview.pdf)。
由於圖像打印到工作目錄,因此它不會顯示在我的Notebook HTML中。有沒有辦法將圖像導回到文檔中,以便將其呈現到HTML文檔中?我不是在減價文檔中工作,而是在通過選擇筆記本圖標(或ctrl + shift + K)編譯成HTML筆記本的常規R腳本中,因此以下減價腳本將不起作用:
![imagename](/images/file.png)
有什麼建議嗎?
我只試了一下Rmarkdown建議,並沒有其他的想法 – plebeau
請發表你至今嘗試過,因爲它並不清楚你所要求的。作爲一般的經驗法則,除了極少數例外情況外,如果需要執行,每個SO問題都應包含代碼和數據。幾乎肯定會由於缺少代碼而引發兩次降價。已添加代碼 –
。謝謝邁克。 – plebeau