在不同的包中編譯依賴的pyx文件

我在編譯不同包中的cdef-ed類型時遇到了問題，我無法在cython文檔中找到解釋。在不同的包中編譯依賴的pyx文件

我有此setup.py在我蟒SRC樹的根：

from distutils.core import setup 
from distutils.extension import Extension 
from Cython.Distutils import build_ext 

setup(
    cmdclass = {'build_ext': build_ext}, 
    ext_modules = [ 
     Extension("flink.pytk.defs.FragIdx", 
     sources = ["flink/pytk/defs/FragIdx.pyx"]), 
     Extension("flink.pytk.fragments.STK_idx", 
     sources = ["flink/pytk/fragments/STK_idx.pyx"]) 
     ] 
)

FragIdx是CDEF-ED型，在定義弗林克/ pytk/DEFS/FragIdx.pyx：

cdef class FragIdx: 
    cdef public FragIdx parent 
    cdef public FragIdx root 
    cdef public tuple label 
    ...

而且STK_idx是FragIdx的延伸，在弗林克定義/ pytk /片段/ STK_idx.pyx：

from flink.pytk.defs.FragIdx import FragIdx 
cdef class STK_idx(FragIdx): 
    ...

當我試圖編譯USI納克在文章開頭列出的setup.py，FragIdx編譯沒事，但是當涉及到STK_idx我收到以下錯誤信息：

flink/pytk/fragments/STK_idx.pyx:5:5: 'FragIdx' is not a type name

請注意，我的源代碼樹的根目錄列在$ PYTHONPATH中。

我真的很感激，如果任何人都可以擺脫這一點，非常感謝！

丹尼爾

來源

2011-03-05 masterpiga

哦，那麼，對於那些有類似的問題，看起來也許我找到了答案。

我期待python自動掃描編譯到共享庫FragIdx.so中的符號，而不是像這樣的信息必須顯式提供爲.pxd文件（在Cython運行後它變成C頭文件）。

基本上有過程中涉及的兩個步驟：

定義（.pxd）文件爲超類的創作;
通過子類模塊中的cimport（而不是import）導入超類定義。

所以，使它更通用。

假設您已經在模塊pkg1.mod1中定義了您的cdef-ed類型A。那麼你可以在pkg2.mod2中輸入B這個類型，它的子類是A。

你的目錄結構會是這個樣子：

pkg1/ 
    mod1.pyx 
    mod1.pxd 
pkg2/ 
    mod2.pyx 
    mod2.pxd

在pkg1/mod1.pxd你會，說：

cdef class A: 
    cdef int a 
    cdef int b

而且在pkg1/mod1.pyx你會提供您的類的方法。在pkg2/mod2.pxd，你會：

from pkg1.mod1 cimport A #note "cimport"!! 
cdef class B(A): 
    cdef ... # your attributes here

再次，在pkg2/mod2.pyx你必須cimport再次符號：

from pkg1.mod1 cimport A #note "cimport"!! 
cdef class B(A): 
    ... # your methods here

有趣的是，如果你只是想在你的Python使用A代碼，而不是使用它來定義子類型，不需要定義文件mod1.pxd。這與創建擴展類型時需要C編譯器可用的定義相關，而運行Python代碼時沒有這個問題，但由於它不是非常直觀，所以指出它可能很重要出。

該信息實際上在Cython docs中可用，但也許它可能會更加明確。

希望這些信息可以爲別人節省一些。

來源

2011-03-05 19:40:25 masterpiga

在不同的包中編譯依賴的pyx文件

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