根據兩個文件之間的匹配創建一個新文件

Question

我有兩個文件

第一個文件是這種格式。每行有唯一的ID開始（在這種情況下P22465）

P22465 DB DB; EC.31.1.1; the annexin (annexin) group. 

第二個文件是在這個format.Each符合（一些數）@ENTREZGENE開始

309@ENTREZGENE|ANXA6_HUMAN@SWISSPROT|P08133@SWISSPROT|ANXA6:ANXA6|67 kDa calelectrin 

30@ENTREZGENE|THIK_HUMAN@SWISSPROT|P22465@SWISSPROT|ACAA1:ACAA1|EC 2.3.1.16 

輸出應該是

30@ENTREZGENE|THIK_HUMAN@SWISSPROT|P22465@SWISSPROT|ACAA1:ACAA1|EC 2.3.1.16 

它應該與第二個文件中包含唯一標識（P22465）的行匹配，並將整行復制到新文件中

Answer 1

使用bash：

fgrep -f <(awk '{print $1}' file1) file2 

這使用過程取代（<(...)）。你也許可以這樣做，也是用：

awk '{print $1}' file1 | fgrep -f - file2 

這告訴fgrep「解讀從標準輸入匹配字符串」（-f -）。我沒有證實這是有效的，但我希望它能這樣做。

您可以使用grep -F代替fgrep（但Mac OS X有fgrep）。