步驟使用biojava

下面是一個典型的輸入.txt文件（也稱爲FASTA文件）讀取文本文件到JTable中的特定列：步驟使用biojava

 
>contig00001 length=586 numreads=4 
CGGGAAATTATCcGCGCCTTCACCGCCGCCGGTTCCACCGACGAACGGATACTGCGtGaa 
ggCCGCGATCCCGTCggaCGGAAAaCGCCcTGGCCCGGGAaCATACCGTTCGGGCCGCCA 
AGTGTTATAGCCGGACCACTTGTCAGAACATTTCCaaTCCGAAGATGTGAGTtCGGAAGg 
TAAAAGCCCGACAAGTTGCGCGgTGAATTTACCTTtACcGCACGATATGCGTCCGTATTA 
AaGAAAaGTTCGAAATTATCAGTAAGGCCGACCTGAAaGCTGACCGGGAGTTCAACAAAA 
TCTGCATCACCcGGgTCACGGTCGAAATTGCTGTACGCGGCGCTGAACGTAAATTCACCC 
TTTcTAAGGGTGTCGCcGTCGTAAACCGTAAaCAaGCCGGTAGCGCCGCCCATCGGGCCG 
CCGGTACCAACCGTCGGTGCCGTGTTTCTtGCATCATTGTCCGATCGAGCGTTCTCGTCC 
GCTTGTGCAAaTCCTGCAaTAGCTAACGTGAAAACGATCAGAGCTGTTGTAAATACTCTA 
TAAGCGAGATTCATCACATTCCTCcGCCGAAATAAAAAGTTAATTt 

>contig00002 length=554 numreads=4 
TGCGCCAaCCGCGCTCTtCATAAaTGGGCACTGCTCCCGATGGCCgACTCGGGCGGTTCG 
CCATGAGATCTTTGCCtACCcAGgAaCtCACcACCAAGTCTGATTGCTGTGTGTTTtCTT 
CAAGTCCCTATTTCTATTCtCTTtAATGGAACCCGTAGGAAACCCGTGTAGGACGCGGGA 
aCCGCACTTgAAGGGGGAGGCGCGGGGTACCGGtCCGGGAACGTACGGGTACCGGCGGGG 
gAGGGGAGGGGGACCgCTCCGGGAAGGCCAGGGGACGGATTGGGGAAGGgCGGGTACCGA 
AGCGGGgAAaTGGGggAaCcGGCGAGAGGGTTCCTCGCTAAGTGGGGGAAATaGGGGAAA 
GGTTGACCAGTGGTtCCCcGCTCTCGTAACATGCCTCAGATAGCGCCATCCGCTGTACCT 
GGtcaggtcGctggcaacttcggccgagcaggtgaacccgaaaggtgagggtcagtgtga 
cacaccaaccgaacaccgacgaggcaagcgtaggagccggcgtggccgcgcccggcggcg 
ctgaggactcctcg

代碼來讀取序列可發現here。

它給正確的輸出，與標籤分離 - 如下所示：

contig00001 586 52.38 
contig00002 554 62.45

的問題是，我公司開發的形式在NetBeans，其由具有5列的JTable的，即：

"contigID","Description","Organism","Sequence_length","Gc_percentage"

和JTextArea。我想在JTable列中顯示上述輸出，而其他列保持空白;當我點擊JTable中的'contig00001'時，應該在JTextArea中顯示相應的序列，如「CGGGAAAT ....」。

我該怎麼做？任何建議，將不勝感激。

來源

2011-06-18 mif

你能告訴我，你究竟粘在了什麼*正確*我在上面的代碼片段中看不到任何Swing/JTable或表格模型代碼。 –

這似乎與此處的作業分配相同：http://stackoverflow.com/questions/6214468/how-to-read-the-given-text-file –

一種方法是擴展AbstractTableModel，如Creating a Table Model中所述。

附錄：通過收聽user selection，您可以確定選擇了哪一行，並相應地更新您的JTextArea。

附錄：由於數據檢索可prtotracted，SwingWorker提供了一個安全的方式變異的TableModel。這是一個簡單的example。

來源

2011-06-18 10:42:37 trashgod

我不完全確定你卡在什麼。如果它將數據添加到JTable，我會考慮創建一個DefaultTableModel對象，使用正確的列標題Strings在數組中創建一個DefaultTableModel對象，其中包含0行數據，然後在讀取文件時添加數據行。 JTable教程應該可以幫助你做到這一切。一旦創建了表模型，就可以通過setModel方法輕鬆地將其添加到JTable中。

來源

2011-06-18 10:47:51

對於DefaultTableModel爲+1。因爲這些文件可以_huge_，我很警惕;但批量進入'JTextArea'。 – trashgod

@trashgod：謝謝，我已經爲您的AbstractTableModel和用戶選擇信息添加了1 +'d。儘管OP在他卡住的地方仍然沒有任何消息。 –

步驟使用biojava

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