使用grep匹配字符串的變化模式

Question

我有一個data.frame，其中包含關於玉米雜交種和玉米近交系的試驗數據。每個近交系在該數據框中都有唯一的條目。另外，我還有玉米雜交種，這是兩條近交系雜交的結果。

我提取了近交系和雜種的所有條目的所有條目，並將它們存儲在兩個單獨的向量中。 '近交' 載體包含每個近交系的編碼條目名稱：

近交< - C（ 「F124」， 「L258」， 「F309」， 「P045」， 「D634」，「D183- 43「，」F205-35「）

載體'hybrid'包含每個雜種的編碼條目名稱。

混合< - C（ 「F124xP045」， 「F124xD183-43」， 「F309xP045」， 「F205-35xL258」， 「F309xD634」）

每個混合有兩個自交系作爲父母，因此'hybrid'向量中的每個字符串都由第一個近交系組成，該第一個近交系與第二個近交系分開了'x'。

我的目標是找出哪些自交系是任何雜種系的親本組分。發生次數對我來說並不重要。最終，我想獲得一個獨特的近交系的新載體，它們是至少一個雜種的一部分，並將它們用於PCA。

我嘗試使用grep（）函數從向量'hybrid'中的vector'inbred'中搜索任何字符串，並使用unique（）函數排除所有多次出現的匹配。我特別的問題是，這種模式總是在變化，因爲我試圖在每次「混合」向量中搜索不同的近交系。

這是我用來獲得唯一匹配的代碼。

unique.parents < - 獨特（grep的（膏（近交，塌陷= 「|」）， 混合，值= TRUE））

unique.parents

[1]「F124xP045 「‘F124xD183-43’‘F309xP045’‘F205-35xL258’‘F309xD634’

我的方法只取得了其中包含的任何自交系，我試圖匹配的雜交品種。

Answer 1

我假設，正如你所說的，「混合型」向量中的每個字符串由第一個近交系組成，它與第二個近交系之間由'x'分開。 因此，你只需要使用「x」作爲拆分器，拆分F1列表並取得獨特的項目。

這很容易：

unique.parents < - 唯一的（不公開（strsplit（混合式，分體式= 「X」）））