分成倉ř

Question

我有以下數據

 

A 1 6 
A 2 72 
A 3 90 
A 4 81 
A 5 81 
A 6 42 
A 7 12 
A 8 32 
A 9 34 
A 10 92 
B 1 44 
B 2 54 
B 3 10 
B 4 21 
B 5 47 
B 6 35 
B 7 94 
B 8 5 
B 9 35 
B 10 77 
B 11 9 
B 12 52 
B 13 73 
B 14 93 
B 15 38 
B 16 85 
B 17 90 
B 18 47 

我的輸出必須是

 
A 1 6 1 
A 2 72 1 
A 3 90 2 
A 4 81 2 
A 5 81 3 
A 6 42 3 
A 7 12 4 
A 8 32 4 
A 9 34 5 
A 10 92 5 
B 1 44 1 
B 2 54 1 
B 3 10 1 
B 4 21 1 
B 5 47 1 
B 6 35 2 
B 7 94 2 
B 8 5 2 
B 9 35 2 
B 10 77 3 
B 11 9 3 
B 12 52 3 
B 13 73 3 
B 14 93 4 
B 15 38 4 
B 16 85 4 
B 17 90 4 
B 18 47 4 

的二進制位（最後）的列必須基於該項目的第一列的長度來計算。因此，對於A = 10/5 = 2在每個倉

對於B，18/5 = 3.6在每個倉....

我使用SEQ 倉= SEQ試圖（來自=，爲=，由=） 但不知道如何繼續。任何幫助，將不勝感激。謝謝

Answer 1

您可以按照here的方法，使用ave來爲數據中的每個組應用函數。

cbind(dat, bin=ave(dat$V2, dat$V1, FUN=function(x) ceiling(seq_along(x)/length(x)*5))) 
# V1 V2 V3 bin 
# 1 A 1 6 1 
# 2 A 2 72 1 
# 3 A 3 90 2 
# 4 A 4 81 2 
# 5 A 5 81 3 
# 6 A 6 42 3 
# 7 A 7 12 4 
# 8 A 8 32 4 
# 9 A 9 34 5 
# 10 A 10 92 5 
# 11 B 1 44 1 
# 12 B 2 54 1 
# 13 B 3 10 1 
# 14 B 4 21 2 
# 15 B 5 47 2 
# 16 B 6 35 2 
# 17 B 7 94 2 
# 18 B 8 5 3 
# 19 B 9 35 3 
# 20 B 10 77 3 
# 21 B 11 9 4 
# 22 B 12 52 4 
# 23 B 13 73 4 
# 24 B 14 93 4 
# 25 B 15 38 5 
# 26 B 16 85 5 
# 27 B 17 90 5 
# 28 B 18 47 5 

Answer 2

我想這

 

    split(df,df$Gene) -> gene 
    gene[1] -> g 
    as.data.frame(g) ->g1 


    FindBin = function(data){ 
    START=0 
    END=length(g1$A.Base) 
    noOfBin=20 
    jump=END/noOfBin 
    bin = seq(from=START, to=END, by=jump) 
    g1$bin_index = findInterval(g1$A.Base, bin) 
    } 
    g1$m1bin=FindBin(g1) 

現在，我得到的垃圾箱..但因爲我已經分裂成DF不同的基因，如何DF

Answer 3

在全部的分割運行此應用data.table：

setDT(x)[,output:=ceiling(5*(1:.N)/.N),by=V1] 
> x 
    V1 V2 V3 output 
1: A 1 6  1 
2: A 2 72  1 
3: A 3 90  2 
4: A 4 81  2 
5: A 5 81  3 
6: A 6 42  3 
7: A 7 12  4 
8: A 8 32  4 
9: A 9 34  5 
10: A 10 92  5 
11: B 1 44  1 
12: B 2 54  1 
13: B 3 10  1 
14: B 4 21  2 
15: B 5 47  2 
16: B 6 35  2 
17: B 7 94  2 
18: B 8 5  3 
19: B 9 35  3 
20: B 10 77  3 
21: B 11 9  4 
22: B 12 52  4 
23: B 13 73  4 
24: B 14 93  4 
25: B 15 38  5 
26: B 16 85  5 
27: B 17 90  5 
28: B 18 47  5 
    V1 V2 V3 output