Q

來自不同文件的和列總和

2015-10-05 65 views -1 likes

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我有一個類似的問題，這裏描述Awk: extract different columns from many different files，但在我的情況下，我有很多文件作爲輸入（可以是40，可以是500），並且每個文件都遵循乳膠格式，如來自不同文件的和列總和

#description & value1 & value2 
    cut1 & XXX & YYY & ZZZ 
    cut2>B & QQQ & TTT & GGG

所以，我想下不同的輸入文件相同的列數來總結所有的值，所以最後我得到這樣

cut1 & SUM_XXX & SUM_YYY & SUM_ZZZ 
cu2>B & SUM_QQQ & SUM_TTT & SUM_GGG

一個新的文件同樣，值可以是科學格式..我想這樣做在bash或python。提前致謝！

2015-10-05 Terma

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您可能會發現蟒蛇['csv'模塊（https://docs.python.org/3.5/library/csv.html ）有幫助。 – lvc

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你需要的是1）讀取文件; 2）使用字符'＆'分割一行（字符串）; 3）總結這些值。您可以在Python中使用csv模塊，也可以使用內置函數自己做。無論哪種方式，我認爲你會減少與python鬥爭，所以試試看，讓我們知道它是如何。 – rll

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只需發佈一些示例輸入和輸出，以便我們有機會提出正確的答案... –

A

回答

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awk來拯救！

如果只有三列聚合這會做

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="&"} 
      {k=$1;a[k]+=$2;b[k]+=$3;c[k]+=$4} 
     END{for(i in a) print i,a[i],b[i],c[i]}' files*

2015-10-05 15:56:58 karakfa

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