.C接口與R - 優文庫

我按照本指南： http://www.biostat.jhsph.edu/~rpeng/docs/interface.pdf .C接口與R

我想C語言創建copiled代碼中的R 使用它，所以我創造了我的hello.c文件：

#include <R.h> 
void hello(int *n) 
{ 
int i; 
for(i=0; i < *n; i++) { 
Rprintf("Hello, world!\n"); 
} 
}

我把它保存在c：\ temp 完成之後，我必須編譯C代碼。

老實說，我沒有任何想法，我在做什麼，但我特林在cmd中窗口寫：

cd C:\Program Files\R\R-3.0.2\bin\ 
R CMD SHLIB c:\temp\hello.c

而我得到的錯誤：

cygwin warning: MS-DOS style path detected: C:/PROGRA~1/R/R-30~1.2/etc/i386/Makeconf Preferred POSIX equivalent is: /cygdrive/c/PROGRA~1/R/R-30~1.2/etc/i386/Makeco nf CYGWIN environment variable option "nodosfilewarning" turns off this warning. Consult the user's guide for more details about POSIX paths: http://cygwin.com/cygwin-ug-net/using.html#using-pathnames make: * No rule to make target c:\temp\hello.o', needed by c:\temp\hello.dll '. Stop.

這應該創建一個文件名「hello.so」。所以我可以把它叫做R：

 dyn.load("hello.so") 

     hello2 <- function(n) { 
           .C("hello", as.integer(n)) 
          } 

     hello2(5)

但是我的命令並沒有創建hello.so文件。也許我需要安裝另一個編譯器，但我無法在我使用的PC上安裝軟件。有沒有辦法做到這一點與Windows CMD？我的錯誤在哪裏？

來源

2014-09-01 dax90

您需要按照R的[附錄D：Windows工具集]（http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#The-Windows-toolset）安裝和管理手冊。 – 2014-09-01 16:56:00

相關問題在這裏：http://stackoverflow.com/questions/13987667/r-external-interface與其他一些資源 – 2014-09-01 19:54:19

我認爲'.C'即將消失。 Dirk在他的答案中提到了它http://stackoverflow.com/questions/23453373/function-c-argument-setup-fails-compilation。推薦'.Call'和'。外部'而不是 – 2014-09-01 20:44:07

假設C:\temp\hello.c查找here，並且還在R docs這從presentation存在從窗戶CMD線（仔細檢查Rtools，R和所使用的路徑存在）嘗試：

cd c:\temp 
path C:\Rtools\bin;C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin;%ProgramFiles%\R\R-3.0.2\bin\x64;%path% 
R CMD SHLIB hello.c 
Rgui

現在R：

dyn.load("hello.dll") 
.C("hello", 3L)

注：也有一些在這裏的批處理文件，可以幫助：

http://batchfiles.googlecode.com

http://code.google.com/p/batchfiles/source/browse/#svn%2Ftrunk

見Rpathset.bat，R.bat和文檔batchfiles.md。

更新更正和改進。

來源

2014-09-01 16:55:26

非常感謝你！它效果非常好！ – dax90 2014-09-02 07:43:48

這並不回答你的問題直接，但你看看Rcpp包，它允許集成（從R調用）C？這可能會讓你的生活變得更容易，這取決於你在做什麼。

德克Ë

來源

2014-09-01 16:52:40

這不會有幫助，因爲它們沒有從源代碼構建C/C++代碼所需的必要工具。 – 2014-09-01 16:53:45

@JoshuaUlrich但安裝'Rtools'後應該可以吧？ – 2014-09-01 16:54:40

不...因爲OP說不能安裝軟件......錯過了。謝謝@Joshua – 2014-09-01 16:56:16