切割成多個字段的第一個字段文件

Question

在下面的文件：

position1 456754 0/1:170,167:339:99:3370,0,3372:50:99:0.496 ./.:.:.:.:.:.:.:. 
position2 456759 0/1:161,162:325:99:3266,0,3215:50:99:0.502 ./.:.:.:.:.:.:.:. 

我想要得到的輸出：

position1 456754 0/1 ./. 
position2 456759 0/1 ./. 

這是第三和第四場，我想獲取包含/

第一場如果只有一列，我可以做到以下幾點：

cut -d " " -f3 - | cut -f1 -d ":" 

粘貼前兩個欄後，這將只給我：

position1 456754 0/1 
position2 456759 0/1 

我的文件總共有200列，如何延長這一對文件中的所有領域？

Answer 1

您可以製作一個awk單行程序，用於拆分包含冒號的字段，並僅用一個子字段替換那些空白分隔的字段。類似這樣的：

$ cat inp.txt 
position1 456754 0/1:170,167:339:99:3370,0,3372:50:99:0.496 ./.:.:.:.:.:.:.:. 
position2 456759 0/1:161,162:325:99:3266,0,3215:50:99:0.502 ./.:.:.:.:.:.:.:. 
$ awk '{ for(i=1; i<=NF; i++) { if($i~/:/){split($i,a,":"); $i=a[1] } } } 1' inp.txt 
position1 456754 0/1 ./. 
position2 456759 0/1 ./. 

for循環遍歷字段列表。然後，如果有任何字段包含冒號，我們將該字段放入一個數組（a），並用第一個元素（a[1]）替換整個字段（$i）。命令字符串末尾的1對於「打印此行」是短暫的，無論是否進行了任何替換，這都會發生。

如果你想在某個CPU爲代價的一個簡單的awk腳本，這也應該工作：

$ awk '{ for(i=1; i<=NF; i++) { split($i,a,":"); $i=a[1] } } 1' inp.txt 

這只是消除了if()條件，這樣對每行每一個領域，你將取代領域與「第一個冒號定界的子領域」。對於沒有冒號的字段，這會將字段替換爲它自己。

或者，對於穩健的解決方案少，你可以使用sed：

$ sed -r -e 's/(:[^ ]*)(|$)/\2/g' inp.txt 
position1 456754 0/1 ./. 
position2 456759 0/1 ./. 

該解決方案的行內讀取和替代字符串，而不是解析領域的awk在做事情的方式。它可能和awk解決方案一樣可靠，雖然可能稍微不靈活（例如awk會讓你採用不同的子域，而sed解決方案則不然）。

注意替換命令結束時的g。這告訴sed執行「全局」替代，而不僅僅是搜索正則表達式的第一個匹配。

此解決方案使用-r選項告訴sed使用擴展正則表達式。如果您使用的是OS X或某些（較早）的BSD unix版本，請使用-E選項。在其他情況下，您可能必須將其轉換爲BRE。

只是兩種方法。我相信在其他答案中會出現更多。