我正在用ggplot繪製三個樣本,但它沒有爲樣本添加圖例。這不是吐出任何錯誤信息,所以我不知道我要去哪裏錯了。我真的會提供一些指導。ggplot不添加圖例。我錯過了什麼?非常新的R
我試圖爲圖例的每個樣本手動聲明顏色,但在圖上仍然沒有圖例。
df<-data.frame(samples$V1, samples$V2, samples$V3, samples$V4, samples$V5, samples$V6, samples$V7)
CG_methplot <- ggplot(df, aes(x=samples$V1,))+
scale_x_continuous(breaks=number_ticks(10))+
xlab("bins")+
ylab("mean CG methylation")+
geom_point(aes(y=samples$V2), size=3, colour='#009933')+
geom_point(aes(y=samples$V3), size=3, colour='#FF0000')+
geom_point(aes(y=samples$V4), size=3, colour='#0033FF')+
scale_color_manual(values=c("samples1"="009933", "sample2"="FF0000", "sample3" ="0033FF"))
CG_methplot
根據要求提供樣品數據。
頭(DF)
samples.V1 samples.V2 samples.V3 samples.V4 samples.V5 samples.V6 samples.V7
1 1 0.033636 0.027857 0.028830 0.029836 0.024457 0.024930
2 2 0.032094 0.029620 0.028005 0.028294 0.026220 0.024105
3 3 0.032011 0.027212 0.029728 0.028211 0.023812 0.025828
4 4 0.030857 0.029833 0.028907 0.027057 0.026433 0.025007
5 5 0.028480 0.028080 0.028553 0.024680 0.024680 0.024653
6 6 0.029445 0.027099 0.029346 0.025645 0.023699 0.025446
您可以通過添加dput的'輸出提供數據的樣本(頭(DF))'到題?簡短的回答是,你想使用'reshape2'中的'melt',然後只需一次調用'geom_point'即可。 –
當然可以!感謝您的幫助:) – user1995839