Matlab SimBiology - 允許自我連接節點

我使用Matlab的SimBiology工具箱生成biograph（它們只是圖表）。Matlab SimBiology - 允許自我連接節點

當我試圖包括連接到本身就是一個節點，例如：

g = [ 
     0 1 0; 
     1 0 1; 
     0 0 1; % This one connects to itself. 
    ]

我得到以下警告消息：

Warning: Self connecting nodes are not allowed, ignoring the diagonal of CM.

正如我的數據集，包括一些自我連接節點，我想知道這是否是一個可配置的功能。

謝謝！

來源

2013-04-18 Ohad Dan

1：好問題。但大多數算法忽略自行循環...我想知道爲什麼你需要它們。 –

@Eitan - 很高興你問過！我的模型是科學期刊參考文獻之間的關係。我圖中的節點是科學期刊，jourA和jourB之間的有向頂點的權重是jourB必須記錄的引用數量（例如 - 過去一年的所有文章）。正如一些文章引用發表在他們自己的雜誌上的文章，我得到循環:)這確實可能不是傳記的經典用法...... –

據我所見，只要循環不是自發的，循環，因爲自循環意味着頂點指向自身。在你的情況下，這不可能發生，因爲一篇文章不能引用它自己。我對嗎？ –

不幸的是，自傳不能有自連接的邊緣。如果您的目的僅用於可視化，則可以添加一些帶有空標籤的節點。這裏是一個小的圖形和兩個自連接節點的示例：

cm = [0 1 1 0 0;1 0 0 1 1;1 0 1 0 0;0 0 0 0 1;1 0 1 0 1]; 
ids = {'M30931','L07625','K03454','M27323','M15390'}; 

sc = find(diag(cm)); 
cm = cm-diag(diag(cm)); 
n = size(cm,1); 
m = numel(sc); 
cm(n+m,n+m)=0; 
cm(sub2ind([n+m,n+m],[sc;(1:m)'+n],[(1:m)'+n;sc]))=1; 
ids((1:m)+n) = {' '}; 

bg = biograph(cm); 
for i = 1:numel(bg.Nodes) 
    bg.Nodes(i).Label = ids{i}; 
    if i>n 
     bg.Nodes(i).Shape = 'circle'; 
    end 
end 
view(bg)

HTH 盧西奧

來源

2013-04-20 13:03:51 user2302162

Matlab SimBiology - 允許自我連接節點

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