的Python：用於循環到一個文件的輸出內容 - 目前輸出最後一排只有

Question

我有一個文件，它看起來像這樣，我想轉：

ID_1 S1 S2 S3 
SNP1 1 0 1 
SNP2 2 1 0 
SNP3 1 0 1 

我做了下面的腳本：

#!/usr/bin/python 

#Script to transpose a large file 

import os 
import sys 

with open(sys.argv[1],'r') as f: 
    m=[] 
    for line in f: 
     m.append(line.strip().split(" ")) 
    for row in zip(*m): 
    result = " ".join(row) 
    with open('transposed.txt','w') as output: 
     output.write(result) 

對於如何將此輸出保存到新文件，我有點失落。我可以這樣寫：

python script.py file_to_transpose.txt > transposed_file.txt 

但我想在腳本中找到一種方法。 預期的輸出是：

ID_1 SNP1 SNP2 SNP3 
S1 1 2 1 
S2 0 1 0 
S3 1 0 1 

但是，我現在的劇本只允許我看獲得最後一行

S3 1 0 1 

Answer 1

寫入到一個文件中的通用的方式是這樣的：

with open('outputfile.txt', 'w') as output: 
    output.write('some string') 

如果你在腳本中這樣做，並用output.write(" ".join(row))代替最終的打印語句，那麼你應該得到結果，除非我誤解了y完全。

編輯：這個問題已經完全改變，可能基於我的答案的上述部分。我會嘗試在這裏回答新問題：

現在的問題是，每次寫入文件時都會重新打開該文件，這會創建一個新文件並擺脫舊文件。因此你只能打印最後一行。打開文件只一次和寫入了好幾次，像這樣：

#!/usr/bin/python 

#Script to transpose a large file 

import os 
import sys 

with open(sys.argv[1],'r') as f, open('transposed.txt','w') as output: 
    m=[] 
    for line in f: 
     m.append(line.strip().split(" ")) 
    for row in zip(*m): 
    result = " ".join(row) 
    output.write(result) 

如果你絕對需要打開該文件幾次（例如，如果你運行整個腳本幾次，需要繼續努力相同的輸出），追加模式，而不是寫模式打開：

with open('transposed.txt', 'a') as output: 
    output.write('This line will be appended at the end of the file\n')