2014-03-04 60 views
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我有兩個問題?
總和,舍入和替換值R

> data<-read.table("UC.txt",header=TRUE, sep="\t") 
> data$tot<-data$P1+data$P2+data$P3+data$P4 
> head(data, 5) 
     geno P1 P2 P3 P4 tot 
    1 G1 0.015 0.007 0.026 0.951 0.999 
    2 G2 0.008 0.006 0.015 0.970 0.999 
    3 G3 0.009 0.006 0.017 0.968 1.000 
    4 G4 0.011 0.007 0.017 0.965 1.000 
    5 G5 0.013 0.005 0.021 0.961 1.000 

問題1:有時,列數不同,因此,如何總結列2到最後一列。像數據[2]:數據[n]的

library("plyr") 
> VD<-function(P4, tot){ 
    if(tot > 1) {return(P4-0.01)} 
    if(tot < 1) {return(P4+0.01)} 
    if(tot == 1) {return(P4)} 
} 
> minu<-ddply(data, 'geno', summarize, Result=VD(P4, tot)) 
> v <- data$geno==minu$geno 
> data[v, "P4"] <- minu[v, "Result"] 
> data <- subset(data, select = -tot) 
> data$tot<-data$P1+data$P2+data$P3+data$P4 
> head(data, 5) 
    geno P1 P2 P3 P4 tot 
1 G1 0.02 0.01 0.03 0.94 1 
2 G2 0.01 0.01 0.02 0.96 1 
3 G3 0.01 0.01 0.02 0.96 1 
4 G4 0.01 0.01 0.02 0.96 1 
5 G5 0.01 0.01 0.02 0.96 1 

問題2:在這裏,我需要舍入 'TOT' 1通過調整P1至P4。
條件:
1)我應該調整P1到P4中的最大值
2)調整值可能不同,如0.01,0.001,0.0001。 (它基於1-tot)
如何做到這一點?
在此先感謝

回答

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對於問題1,總結除了第一個所有列:

dat$tot <- rowSums(dat[,-1])