解析來自多個文件夾的CSV文件

Question

我有一個包含多個子文件夾的文件夾，每個子文件夾包含不同類型的文件，有時還包含一個名爲 run.csv的文件。但是，CSV文件始終命名爲run.csv，並且始終包含列ID，通道，索引等。

我知道如何解析CSV文件，但無法弄清楚如何遍歷子文件夾並打印所有的id，lane和index列，而不需要所有CSV文件的頭信息。爲此，我應該理想地使用perl語言。

Answer 1

我想你想要的是glob：

foreach my $csv_file (glob "/path/to/dir/*/run.csv") { 
    #process CSV. 
} 

但它可能你想File::Find::Rule：

foreach my $file (File::Find::Rule -> name ('run.csv') -> in ("/path/to/dir")) { 
    print $file,"\n"; 
} 

這的確大同小異，但遞歸。在這兩種情況下，您都會獲得當前目錄的相對路徑，因此可以直接將它傳遞給open。