如何使用R改變y尺度，以大步驟開始，然後以短步驟完成，以突出處理之間的差異？

我想繪製兩個細胞羣體之間的平均差異，這是非常有意義的（P < 0.001）。然而，使用的規模不適合看到這種差異。這裏是我的代碼：如何使用R改變y尺度，以大步驟開始，然後以短步驟完成，以突出處理之間的差異？

ggplot(sh2_sum, aes(treatment,diameter,fill=treatment)) + 
    geom_bar(colour='black', width=.7, position=position_dodge(), 
      stat='identity',size=.2) + 
    coord_cartesian(ylim=c(0, .4)) + 
    xlab("") + ylab("Diámetro de la cabeza de la espina (µm)") + 
    scale_fill_manual(values=c("#009900", "#990000"),name='') + 
    geom_errorbar(aes(ymin=diameter, ymax=diameter+se),width=.3, 
        size=.2,position=position_dodge(.7)) + 
    theme(legend.direction='horizontal',legend.position=c(.5325,-.085), 
      plot.margin=unit(c(0,1,1,1),'cm'), axis.text.x = element_blank()) + 
    annotate("text", x=2, y=.355, label="* * *")

這是圖我得到：

original graph

我曾嘗試使用scale_y_log10()但我得到以下錯誤：

Error in seq.default(min, max, by = by) : 'from' must be a finite number In addition: Warning message: Transformation introduced infinite values in continuous y-axis

我會喜歡使用scale_y_sqrt這種類型的值，從0到3的值很短，然後從3到4的值很大，所以差值是可見的ible 任何想法？

來源

2017-10-28 Dementor Yea

我想你應該考慮放大一下你對'coord_cartesian'感興趣的領域，或者把'geom_bar'完全放在'geom_pointrange'的位置，而不是引入任意的尺度轉換 –

平方根和日誌會放大'y'較小時的差異，'y'較大時的壓縮值。翹曲你的數據，使其看起來相對差異比實際大，你會想要某種指數變換，也許'exp（y）'或'y^2'。或者，不那麼具有欺騙性，按照Mikko的建議 - 線圖或散點圖預計不會從0開始，因此您可以更多地關注差異而不是絕對量級。 – Gregor

對數轉換後的y軸從不對於條形圖是有意義的，因爲bars always start at 0和log（0）不是有用的值（因此是錯誤消息）。

您可以使用其他，零微轉換（例如asinh），但容易很多，也更有意義的，解決辦法是拋棄條形圖和使用的箱線圖（geom_boxplot）來代替。

實際上，你所擁有的稱爲「dynamite plot」，它是一個經典的可視化anti-pattern。

來源

2017-10-28 13:34:30

如何使用R改變y尺度，以大步驟開始，然後以短步驟完成，以突出處理之間的差異？

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