2017-08-21 33 views
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我有一個DB2和R連接的奇怪問題。我可以訪問數據庫,但可以查詢數據但我無法從R存儲數據。我使用R的RODBC包。我遵循這裏編寫的指南https://www.ibm.com/developerworks/data/library/techarticle/dm-1402db2andr/index.html從技術上講,此包從R對象創建「INSERT INTO」語句,並且在DB2上執行它以存儲來自R的數據(我有必要的憑據在數據庫上執行這些操作。)將數據從R存儲到DB2不起作用

我試過的是以下內容(我使用R和SQuirreL - http://squirrel-sql.sourceforge.net/ - 一起測試多個單向):

使用SQuirreL創建一個包含3列和25條記錄的測試表。 然後我從R查詢這個表。 我嘗試將結果數據集中的第一條記錄(從2)保存到同一個表中。 然後我從R中查詢表 - 附加行。 然後我從SQuirreL查詢。 這裏的問題發生在這裏,而我連接到R和INSERT後。在(4)我看到添加的記錄,但我無法從SQuirreL(5)中查詢它。 R似乎鎖定了整個桌子。當我用R與數據庫斷開連接時,它不會得到解決,我還會得到2條錯誤消息(我懷疑這些錯誤消息是相關的)。當我退出R然後它解決了,我可以從SQuirreL查詢我的表,但附加的記錄消失。

我試圖從R發送的SQuirreL運行相同的SQL語句。我沒有收到錯誤消息,並且記錄被追加。因此R使用的方法應該可以工作。我不知道它在哪裏橫着。

我附上了我的表和使用的R腳本(包括運行時間消息)的示例數據。以下是CREATE TABLE語句。該表還沒有任何索引或鍵,因此不會禁止添加重複記錄。

 create table dm_quant.test (
     r_date   date, 
     cid    varchar(255), 
     priv_person  varchar(255) 
    ); 

有沒有人遇到同樣的困難?如果是這樣,我該如何解決它?

提前致謝!

#connect-to-db2 
    rm(list=ls(all=TRUE)) 
    gc(reset = TRUE) 

    require(RODBC) 

    dsn_name <- "DB2_DB" 
    user <- "user" 
    pwd <- "pass" 


    channel <- odbcConnect(dsn = dsn_name, uid = user, pwd) 

    table_list <- sqlTables(channel, tableType = "TABLE", schema = "DM_QUANT") 
    cat("There are", nrow(table_list), "tables in the DM_QUANT schema.\n") 
    # There are 4 tables in the DM_QUANT schema. 

    table_name <- "DM_QUANT.TEST" 
    col_list <- sqlColumns(channel, table_name) 
    cat("There are", nrow(col_list), "columns defined in", table_name,"\n") 
    # There are 3 columns defined in DM_QUANT.TEST 

    ## Fetch test table (25 records) 
    test_tbl <- sqlQuery(channel, paste("SELECT * FROM ", table_name, sep = ""), 
         as.is = TRUE, na.strings = "") 

    ## Determine varTypes parameter for sqlSave 
    db2_var_types <- data.frame(var = col_list$COLUMN_NAME, 
           var_type = col_list$TYPE_NAME, 
           var_type_ext = paste(col_list$TYPE_NAME, "(", col_list$COLUMN_SIZE, ")", sep = ""), 
           stringsAsFactors = F) 

    db2_var_types$final_var_type <- db2_var_types$var_type 

    ## Adding size for VARCHAR variable type. 
    db2_var_types$final_var_type[db2_var_types$var_type == "VARCHAR"] <- db2_var_types$var_type_ext[db2_var_types$var_type == "VARCHAR"] 


    ## Append - append 1st record of the current table again. 
    sqlSave(channel, test_tbl[1,], tablename = table_name, append = T, verbose = T, 
      fast = F, rownames = F, colnames = F, varTypes = db2_var_types$final_var_type) 
    # Query: INSERT INTO DM_QUANT.TEST ("R_DATE", "CID", "PRIV_PERSON") VALUES ('2016-06-30', '193303', 'N') 

    ## After I use sqlSave I cannot query from the database from SQuirreL SQL Client. 
    ## Seems like I'm locking the whole table by R. 

    ## Test append 
    ## customer_test <- sqlFetch(channel, table_name) 
    test_append <- sqlQuery(channel, paste("SELECT * FROM ", table_name, sep = ""), 
           as.is = TRUE, na.strings = "") 

    nrow(test_append) 
    # [1] 26 
    nrow(test_append) == nrow(test_tbl) + 1 
    # [1] TRUE 

    ## Append seems successfull 
    cat("Record appended successfully.\n") 


    ## Close connections 
    odbcCloseAll() 
    cat("Database connections are closed.\n") 

    ## Always closes with 2 error message 
    # 1: [RODBC] Error in SQLDisconnect 
    # 2: [RODBC] Error in SQLFreeconnect 

    ## I still cannot query from SQuirreL SQL Client untill I close R completely 
    ## After I close and test query from SQuirreL, I cannot see the appended record. 

我用於測試的Excel文件。

 **sample-data** 
    R_DATE  CID PRIV_PERSON 
    2016.06.30 193303 N 
    2016.06.30 808739 N 
    2016.06.30 585008 N 
    2016.06.30 479872 N 
    2016.06.30 350290 N 
    2016.06.30 895961 N 
    2016.06.30 822839 N 
    2016.06.30 746603 N 
    2016.06.30 174107 N 
    2016.06.30 858942 N 
    2016.06.30 710500 N 
    2016.06.30 513533 N 
    2016.06.30 303993 N 
    2016.06.30 14983 N 
    2016.06.30 91401 N 
    2016.06.30 364451 N 
    2016.06.30 147311 N 
    2016.06.30 165897 N 
    2016.06.30 988524 N 
    2016.06.30 445691 N 
    2016.06.30 119082 N 
    2016.06.30 4668 N 
    2016.06.30 8910 N 
    2017.12.31 377879 
    2016.06.30 531661 N 

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禁用自動提交會解釋此行爲。更新或插入的行保持鎖定狀態,直到它們被提交。當您強制關閉連接時,更改可能會回滾。

建立連接後立即嘗試odbcSetAutoCommit(channel, autoCommit = TRUE)。或者,您可以在sqlSave()後發出odbcEndTran(channel, commit = TRUE)

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謝謝你的幫助,它解決了這個問題。 – ParraghG