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如何在R包開發中使用git？

2012-11-17 19 views 9 likes

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我是R的新手，已經開始編寫一箇中型項目。儘管它將作爲應用程序的一部分進行分發，但我決定從中製作一個軟件包以使組織更加整潔。如何在R包開發中使用git？

當我使用版本控制時，如何處理DESCRIPTION文件需要版本和日期字段的事實？我不想用每個git commit來更改該文件。

有沒有一個標準的Makefile的地方呢？

此外，我並不完全清楚如何做到這一點，並仍然能夠在開發過程中使用該軟件包。

2012-11-17 Andreas

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您可能不希望爲回購協議中的每個更改增加包編號 - 目前沒有好的工具可以執行此操作，而且它沒有什麼優勢。 – hadley

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@hadley：不，但能夠找到用戶正在使用的版本是出於支持目的，而且我們還有一個用例，它將包的版本作爲元數據存儲在數據清理/處理套件中（爲科學再現性）。也許某種pre/post-build掛鉤可以更新DESCRIPTION和一個小函數來解析出git修訂版。後綴構建掛鉤在https://stackoverflow.com/questions/32035151/executing-r-腳本在包安裝過程中＃comment51982053_32035219，但我無法在其他地方找到任何細節。 – naught101

A

回答

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如果使用devtools包你沒有建立和每個編輯之後安裝包 - 只需使用load_all()和工作在你的工作會議上完成的，因此您可以測試您的更改（理想與testthat包）。

我寫了RPub一下：http://www.rpubs.com/geospacedman/lazydevtools

你仍然可以構建一個軟件包的源碼包分配的選項。

請注意，git不會促進每次提交時自動更新文件位的機制，例如SVN中的$ id $ thing。 Linus本人說，這是「愚蠢」和「笨」：

http://www.gelato.unsw.edu.au/archives/git/0610/28891.html

2012-11-17 15:58:53 Spacedman

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如果您是R的新手，我推薦使用RStudio，這在我看來是最先進的R-IDE。它提供了：package building以及version control。

我不想用每個git commit來更改該文件。 ... 此外，我不是，我怎麼會做這個，仍然能夠在開發使用包完全清楚。

那麼通常你就必須安裝與和開發當地的Git倉庫工作的一個包。當開發到達下一個包版本的狀態時，您將更改DESCRIPTION文件中的日期和版本。在兩個版本之間，您可以創建多個階段，根據需要提交併推送到您的GIT。

2012-11-17 13:55:23 Beasterfield

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那些克隆回購的人呢？他們將有一個無效的包，因爲DESCRIPTION不會與實際內容相符：DESCRIPTION中的版本不會是代碼的版本。 – Andreas

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也許我正在尋找某種commit-hook來更新git版本號爲 – Andreas

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@Andreas的版本要麼我很困惑，要麼你非常困惑，因爲你對DESCRIPTION文件中的版本的擔心使得絕對對我沒有意義。 – joran

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我不會改變DESCRIPTION爲每次提交，但我更新日期，我把當前YYYYMMDD日期的版本破折號後每次我真正建立包裝。這是每天晚上的建築記錄。

目前我有一個包在一個相當積極的發展階段，是由幾個不同的同事的需求驅動。在次要版本的日期是方便，因爲我可以很容易地問同事「什麼日期是您使用的版本呢？sessionInfo()顯示它。」

2012-11-17 17:16:46 cbeleites

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