Rstudio-server環境變量未加載？

我試圖在Cloudera的hadoop發行版上運行rhadoop（我不記得它的CDH3或4），並且遇到了一個問題：Rstudio服務器似乎無法識別我的全局變量。Rstudio-server環境變量未加載？

在我/etc/profile.d/r.sh文件，我有：

export HADOOP_HOME=/usr/lib/hadoop 
export HADOOP_CONF=/usr/hadoop/conf 
export HADOOP_CMD=/usr/bin/hadoop 
export HADOOP_STREAMING=/usr/lib/hadoop-mapreduce/

當我從終端運行R，我得到：

> Sys.getenv("HADOOP_CMD") 
[1] "usr/bin/hadoop"

但是當我運行Rstudio服務器：

> Sys.getenv("HADOOP_CMD") 
[1] ""

這樣做的結果，當我嘗試運行rhdfs：

> library("rJava", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15") 
> library("rhdfs", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15") 
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rhdfs', details: 
    call: fun(libname, pkgname) 
    error: Environment variable HADOOP_CMD must be set before loading package rhdfs 
Error: package/namespace load failed for 'rhdfs'

有誰知道我應該把我的環境變量，如果不是在那個特定的r.sh文件？

謝謝！

來源

2013-06-01 AI52487963

您應該在.Renviron或Renviron.site中設置您的環境變量。我認爲這些文件在R_HOME/etc/Renviron.site下定義。您可以通過鍵入獲得更多信息：

> ?Startup

有人也有類似的問題here，這是他做了什麼來解決這個問題。

來源

2013-06-01 00:25:53

嗯...我加入 HADOOP_CMD = 「在/ usr/bin中/ Hadoop的」了我的〜/ .Rprofile，但似乎並沒有這樣的伎倆。 Rstudio服務器仍然爲Sys.getenv（「HADOOP_CMD」）提供結果。 – AI52487963

爲我工作我將'SOMEVAR =/somepath'添加到'/ usr/lib/R/etc/Renviron'。 'R.home（）=「/ usr/lib/R」'。我重新啓動了RStudio，並且'Sys.getenv（'SOMEVAR'）'正確地找到了該變量。 – user1609452

對不起，我是rstudio-server的新手，似乎無法弄清楚Renviron配置文件的位置。在'/ usr/lib /'中，我只有'firstudio-server'和子文件夾'bin'，'extras'，'R'，'resources'和'www'。有推薦的地方啓動一個Renviron文件嗎？ – AI52487963

你應該設置環境變量Rstudio像

Sys.setenv（「到Hadoop的/路徑」）

，然後你試試這個

來源

2014-07-14 11:43:55 user3273633

這是解決路徑問題的有效方法，但請注意，正確的語法是'Sys.setenv（HADOOP_CMD =「/ path/to/hadoop」）'。 – FvD

需要注意的是在Windows上，R會尋找.Renviron文件位於/Users/<name>/Documents，而RStudio似乎預計.Renviron文件位於/Users/<name>/。

來源

2015-11-26 02:53:52

Rstudio-server環境變量未加載？

回答

相關問題